Protein–RNA interactions for Protein: Q78JN3

Eci3, Enoyl-CoA delta isomerase 3, peroxisomal, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eci3Q78JN3 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Eci3Q78JN3 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Eci3Q78JN3 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Eci3Q78JN3 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Eci3Q78JN3 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Eci3Q78JN3 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Eci3Q78JN3 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Eci3Q78JN3 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Eci3Q78JN3 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Eci3Q78JN3 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Eci3Q78JN3 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Eci3Q78JN3 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Eci3Q78JN3 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Eci3Q78JN3 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Eci3Q78JN3 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Eci3Q78JN3 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Eci3Q78JN3 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Eci3Q78JN3 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Eci3Q78JN3 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Eci3Q78JN3 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Eci3Q78JN3 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Eci3Q78JN3 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Eci3Q78JN3 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Eci3Q78JN3 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Eci3Q78JN3 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Eci3Q78JN3 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Eci3Q78JN3 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Eci3Q78JN3 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Eci3Q78JN3 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Eci3Q78JN3 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Eci3Q78JN3 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Eci3Q78JN3 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Eci3Q78JN3 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Eci3Q78JN3 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Eci3Q78JN3 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Eci3Q78JN3 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Eci3Q78JN3 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Eci3Q78JN3 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Eci3Q78JN3 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Eci3Q78JN3 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Eci3Q78JN3 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Eci3Q78JN3 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Eci3Q78JN3 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Eci3Q78JN3 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Eci3Q78JN3 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Eci3Q78JN3 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Eci3Q78JN3 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Eci3Q78JN3 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Eci3Q78JN3 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Eci3Q78JN3 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Eci3Q78JN3 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Eci3Q78JN3 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Eci3Q78JN3 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Eci3Q78JN3 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Eci3Q78JN3 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Eci3Q78JN3 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Eci3Q78JN3 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Eci3Q78JN3 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Eci3Q78JN3 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Eci3Q78JN3 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Eci3Q78JN3 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Eci3Q78JN3 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Eci3Q78JN3 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Eci3Q78JN3 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Eci3Q78JN3 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Eci3Q78JN3 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Eci3Q78JN3 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Eci3Q78JN3 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Eci3Q78JN3 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Eci3Q78JN3 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Eci3Q78JN3 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Eci3Q78JN3 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Eci3Q78JN3 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Eci3Q78JN3 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Eci3Q78JN3 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Eci3Q78JN3 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Eci3Q78JN3 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Eci3Q78JN3 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Eci3Q78JN3 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Eci3Q78JN3 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Eci3Q78JN3 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Eci3Q78JN3 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Eci3Q78JN3 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Eci3Q78JN3 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Eci3Q78JN3 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Eci3Q78JN3 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Eci3Q78JN3 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Eci3Q78JN3 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Eci3Q78JN3 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Eci3Q78JN3 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Eci3Q78JN3 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Eci3Q78JN3 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Eci3Q78JN3 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Eci3Q78JN3 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Eci3Q78JN3 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Eci3Q78JN3 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Eci3Q78JN3 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Eci3Q78JN3 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Eci3Q78JN3 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Eci3Q78JN3 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.8 ms