Protein–RNA interactions for Protein: Q78IS1

Tmed3, Transmembrane emp24 domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed3Q78IS1 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tmed3Q78IS1 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tmed3Q78IS1 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tmed3Q78IS1 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tmed3Q78IS1 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tmed3Q78IS1 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Tmed3Q78IS1 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Tmed3Q78IS1 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tmed3Q78IS1 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tmed3Q78IS1 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tmed3Q78IS1 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tmed3Q78IS1 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tmed3Q78IS1 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tmed3Q78IS1 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tmed3Q78IS1 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tmed3Q78IS1 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tmed3Q78IS1 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tmed3Q78IS1 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tmed3Q78IS1 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tmed3Q78IS1 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tmed3Q78IS1 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tmed3Q78IS1 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tmed3Q78IS1 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tmed3Q78IS1 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tmed3Q78IS1 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tmed3Q78IS1 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tmed3Q78IS1 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tmed3Q78IS1 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tmed3Q78IS1 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tmed3Q78IS1 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tmed3Q78IS1 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tmed3Q78IS1 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tmed3Q78IS1 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tmed3Q78IS1 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tmed3Q78IS1 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tmed3Q78IS1 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tmed3Q78IS1 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tmed3Q78IS1 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tmed3Q78IS1 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tmed3Q78IS1 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tmed3Q78IS1 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tmed3Q78IS1 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tmed3Q78IS1 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tmed3Q78IS1 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tmed3Q78IS1 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tmed3Q78IS1 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Tmed3Q78IS1 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tmed3Q78IS1 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tmed3Q78IS1 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tmed3Q78IS1 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tmed3Q78IS1 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tmed3Q78IS1 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tmed3Q78IS1 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tmed3Q78IS1 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tmed3Q78IS1 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Tmed3Q78IS1 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tmed3Q78IS1 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tmed3Q78IS1 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tmed3Q78IS1 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tmed3Q78IS1 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tmed3Q78IS1 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tmed3Q78IS1 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tmed3Q78IS1 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tmed3Q78IS1 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tmed3Q78IS1 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tmed3Q78IS1 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tmed3Q78IS1 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tmed3Q78IS1 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tmed3Q78IS1 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tmed3Q78IS1 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tmed3Q78IS1 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tmed3Q78IS1 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tmed3Q78IS1 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tmed3Q78IS1 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tmed3Q78IS1 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tmed3Q78IS1 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tmed3Q78IS1 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tmed3Q78IS1 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tmed3Q78IS1 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tmed3Q78IS1 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tmed3Q78IS1 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tmed3Q78IS1 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tmed3Q78IS1 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Tmed3Q78IS1 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tmed3Q78IS1 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tmed3Q78IS1 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tmed3Q78IS1 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tmed3Q78IS1 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tmed3Q78IS1 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tmed3Q78IS1 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tmed3Q78IS1 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tmed3Q78IS1 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tmed3Q78IS1 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tmed3Q78IS1 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tmed3Q78IS1 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tmed3Q78IS1 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tmed3Q78IS1 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tmed3Q78IS1 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tmed3Q78IS1 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tmed3Q78IS1 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms