Protein–RNA interactions for Protein: Q6W8Q3

Pcp4l1, Purkinje cell protein 4-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 68 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcp4l1Q6W8Q3 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pcp4l1Q6W8Q3 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pcp4l1Q6W8Q3 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pcp4l1Q6W8Q3 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pcp4l1Q6W8Q3 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pcp4l1Q6W8Q3 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pcp4l1Q6W8Q3 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pcp4l1Q6W8Q3 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pcp4l1Q6W8Q3 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pcp4l1Q6W8Q3 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pcp4l1Q6W8Q3 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pcp4l1Q6W8Q3 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pcp4l1Q6W8Q3 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pcp4l1Q6W8Q3 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pcp4l1Q6W8Q3 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pcp4l1Q6W8Q3 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pcp4l1Q6W8Q3 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pcp4l1Q6W8Q3 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pcp4l1Q6W8Q3 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pcp4l1Q6W8Q3 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pcp4l1Q6W8Q3 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pcp4l1Q6W8Q3 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pcp4l1Q6W8Q3 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pcp4l1Q6W8Q3 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pcp4l1Q6W8Q3 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pcp4l1Q6W8Q3 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pcp4l1Q6W8Q3 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pcp4l1Q6W8Q3 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pcp4l1Q6W8Q3 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pcp4l1Q6W8Q3 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pcp4l1Q6W8Q3 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pcp4l1Q6W8Q3 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pcp4l1Q6W8Q3 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pcp4l1Q6W8Q3 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pcp4l1Q6W8Q3 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pcp4l1Q6W8Q3 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pcp4l1Q6W8Q3 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pcp4l1Q6W8Q3 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pcp4l1Q6W8Q3 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pcp4l1Q6W8Q3 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pcp4l1Q6W8Q3 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pcp4l1Q6W8Q3 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pcp4l1Q6W8Q3 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pcp4l1Q6W8Q3 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pcp4l1Q6W8Q3 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pcp4l1Q6W8Q3 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pcp4l1Q6W8Q3 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pcp4l1Q6W8Q3 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pcp4l1Q6W8Q3 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pcp4l1Q6W8Q3 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pcp4l1Q6W8Q3 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pcp4l1Q6W8Q3 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pcp4l1Q6W8Q3 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pcp4l1Q6W8Q3 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pcp4l1Q6W8Q3 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pcp4l1Q6W8Q3 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Pcp4l1Q6W8Q3 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pcp4l1Q6W8Q3 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pcp4l1Q6W8Q3 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pcp4l1Q6W8Q3 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pcp4l1Q6W8Q3 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pcp4l1Q6W8Q3 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pcp4l1Q6W8Q3 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pcp4l1Q6W8Q3 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pcp4l1Q6W8Q3 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pcp4l1Q6W8Q3 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pcp4l1Q6W8Q3 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pcp4l1Q6W8Q3 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pcp4l1Q6W8Q3 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pcp4l1Q6W8Q3 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pcp4l1Q6W8Q3 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pcp4l1Q6W8Q3 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pcp4l1Q6W8Q3 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pcp4l1Q6W8Q3 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pcp4l1Q6W8Q3 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pcp4l1Q6W8Q3 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pcp4l1Q6W8Q3 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pcp4l1Q6W8Q3 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pcp4l1Q6W8Q3 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pcp4l1Q6W8Q3 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pcp4l1Q6W8Q3 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pcp4l1Q6W8Q3 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pcp4l1Q6W8Q3 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Pcp4l1Q6W8Q3 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pcp4l1Q6W8Q3 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pcp4l1Q6W8Q3 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pcp4l1Q6W8Q3 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pcp4l1Q6W8Q3 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pcp4l1Q6W8Q3 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pcp4l1Q6W8Q3 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pcp4l1Q6W8Q3 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pcp4l1Q6W8Q3 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pcp4l1Q6W8Q3 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pcp4l1Q6W8Q3 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pcp4l1Q6W8Q3 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pcp4l1Q6W8Q3 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pcp4l1Q6W8Q3 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pcp4l1Q6W8Q3 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pcp4l1Q6W8Q3 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pcp4l1Q6W8Q3 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
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