Protein–RNA interactions for Protein: Q6PGF3

Med16, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 16, mousemouse

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med16Q6PGF3 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Med16Q6PGF3 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Med16Q6PGF3 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Med16Q6PGF3 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Med16Q6PGF3 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Med16Q6PGF3 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Med16Q6PGF3 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Med16Q6PGF3 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Med16Q6PGF3 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Med16Q6PGF3 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Med16Q6PGF3 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Med16Q6PGF3 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Med16Q6PGF3 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Med16Q6PGF3 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Med16Q6PGF3 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Med16Q6PGF3 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Med16Q6PGF3 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Med16Q6PGF3 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Med16Q6PGF3 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Med16Q6PGF3 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Med16Q6PGF3 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Med16Q6PGF3 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Med16Q6PGF3 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Med16Q6PGF3 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Med16Q6PGF3 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Med16Q6PGF3 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Med16Q6PGF3 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Med16Q6PGF3 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Med16Q6PGF3 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Med16Q6PGF3 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Med16Q6PGF3 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Med16Q6PGF3 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Med16Q6PGF3 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Med16Q6PGF3 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Med16Q6PGF3 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Med16Q6PGF3 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Med16Q6PGF3 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Med16Q6PGF3 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Med16Q6PGF3 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Med16Q6PGF3 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Med16Q6PGF3 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Med16Q6PGF3 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Med16Q6PGF3 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Med16Q6PGF3 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Med16Q6PGF3 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Med16Q6PGF3 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Med16Q6PGF3 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Med16Q6PGF3 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Med16Q6PGF3 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Med16Q6PGF3 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Med16Q6PGF3 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Med16Q6PGF3 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Med16Q6PGF3 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Med16Q6PGF3 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Med16Q6PGF3 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Med16Q6PGF3 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Med16Q6PGF3 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Med16Q6PGF3 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Med16Q6PGF3 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Med16Q6PGF3 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Med16Q6PGF3 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Med16Q6PGF3 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Med16Q6PGF3 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Med16Q6PGF3 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Med16Q6PGF3 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Med16Q6PGF3 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Med16Q6PGF3 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Med16Q6PGF3 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Med16Q6PGF3 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Med16Q6PGF3 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Med16Q6PGF3 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Med16Q6PGF3 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Med16Q6PGF3 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Med16Q6PGF3 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Med16Q6PGF3 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Med16Q6PGF3 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Med16Q6PGF3 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Med16Q6PGF3 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Med16Q6PGF3 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Med16Q6PGF3 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Med16Q6PGF3 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Med16Q6PGF3 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Med16Q6PGF3 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Med16Q6PGF3 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Med16Q6PGF3 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Med16Q6PGF3 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Med16Q6PGF3 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Med16Q6PGF3 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Med16Q6PGF3 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Med16Q6PGF3 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Med16Q6PGF3 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Med16Q6PGF3 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Med16Q6PGF3 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Med16Q6PGF3 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Med16Q6PGF3 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Med16Q6PGF3 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Med16Q6PGF3 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Med16Q6PGF3 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Med16Q6PGF3 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Med16Q6PGF3 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms