Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU5

Cltb, Clathrin light chain B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltbQ6IRU5 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CltbQ6IRU5 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CltbQ6IRU5 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CltbQ6IRU5 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CltbQ6IRU5 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CltbQ6IRU5 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CltbQ6IRU5 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CltbQ6IRU5 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CltbQ6IRU5 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CltbQ6IRU5 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CltbQ6IRU5 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CltbQ6IRU5 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CltbQ6IRU5 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CltbQ6IRU5 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CltbQ6IRU5 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CltbQ6IRU5 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CltbQ6IRU5 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CltbQ6IRU5 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CltbQ6IRU5 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CltbQ6IRU5 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CltbQ6IRU5 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CltbQ6IRU5 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CltbQ6IRU5 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CltbQ6IRU5 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CltbQ6IRU5 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CltbQ6IRU5 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CltbQ6IRU5 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CltbQ6IRU5 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CltbQ6IRU5 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CltbQ6IRU5 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CltbQ6IRU5 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CltbQ6IRU5 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CltbQ6IRU5 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CltbQ6IRU5 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CltbQ6IRU5 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CltbQ6IRU5 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CltbQ6IRU5 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CltbQ6IRU5 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CltbQ6IRU5 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CltbQ6IRU5 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CltbQ6IRU5 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CltbQ6IRU5 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CltbQ6IRU5 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CltbQ6IRU5 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CltbQ6IRU5 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CltbQ6IRU5 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CltbQ6IRU5 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CltbQ6IRU5 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CltbQ6IRU5 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CltbQ6IRU5 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CltbQ6IRU5 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CltbQ6IRU5 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CltbQ6IRU5 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CltbQ6IRU5 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CltbQ6IRU5 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CltbQ6IRU5 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CltbQ6IRU5 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CltbQ6IRU5 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CltbQ6IRU5 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CltbQ6IRU5 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CltbQ6IRU5 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CltbQ6IRU5 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CltbQ6IRU5 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CltbQ6IRU5 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CltbQ6IRU5 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CltbQ6IRU5 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CltbQ6IRU5 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CltbQ6IRU5 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CltbQ6IRU5 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CltbQ6IRU5 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CltbQ6IRU5 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CltbQ6IRU5 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CltbQ6IRU5 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CltbQ6IRU5 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CltbQ6IRU5 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CltbQ6IRU5 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CltbQ6IRU5 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CltbQ6IRU5 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CltbQ6IRU5 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CltbQ6IRU5 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CltbQ6IRU5 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CltbQ6IRU5 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CltbQ6IRU5 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CltbQ6IRU5 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CltbQ6IRU5 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CltbQ6IRU5 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CltbQ6IRU5 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CltbQ6IRU5 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CltbQ6IRU5 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CltbQ6IRU5 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CltbQ6IRU5 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CltbQ6IRU5 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CltbQ6IRU5 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CltbQ6IRU5 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CltbQ6IRU5 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CltbQ6IRU5 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CltbQ6IRU5 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CltbQ6IRU5 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CltbQ6IRU5 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CltbQ6IRU5 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms