Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRT3

Parpbp, PCNA-interacting partner, mousemouse

Predictions only

Length 573 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ParpbpQ6IRT3 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ParpbpQ6IRT3 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ParpbpQ6IRT3 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ParpbpQ6IRT3 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ParpbpQ6IRT3 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ParpbpQ6IRT3 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ParpbpQ6IRT3 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ParpbpQ6IRT3 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ParpbpQ6IRT3 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ParpbpQ6IRT3 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ParpbpQ6IRT3 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ParpbpQ6IRT3 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ParpbpQ6IRT3 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ParpbpQ6IRT3 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ParpbpQ6IRT3 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ParpbpQ6IRT3 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ParpbpQ6IRT3 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ParpbpQ6IRT3 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ParpbpQ6IRT3 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ParpbpQ6IRT3 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ParpbpQ6IRT3 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ParpbpQ6IRT3 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ParpbpQ6IRT3 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ParpbpQ6IRT3 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ParpbpQ6IRT3 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ParpbpQ6IRT3 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ParpbpQ6IRT3 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ParpbpQ6IRT3 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ParpbpQ6IRT3 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ParpbpQ6IRT3 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ParpbpQ6IRT3 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ParpbpQ6IRT3 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ParpbpQ6IRT3 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ParpbpQ6IRT3 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ParpbpQ6IRT3 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ParpbpQ6IRT3 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ParpbpQ6IRT3 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ParpbpQ6IRT3 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ParpbpQ6IRT3 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ParpbpQ6IRT3 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ParpbpQ6IRT3 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ParpbpQ6IRT3 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ParpbpQ6IRT3 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ParpbpQ6IRT3 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ParpbpQ6IRT3 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ParpbpQ6IRT3 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ParpbpQ6IRT3 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ParpbpQ6IRT3 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ParpbpQ6IRT3 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ParpbpQ6IRT3 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ParpbpQ6IRT3 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ParpbpQ6IRT3 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ParpbpQ6IRT3 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ParpbpQ6IRT3 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ParpbpQ6IRT3 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ParpbpQ6IRT3 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ParpbpQ6IRT3 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ParpbpQ6IRT3 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ParpbpQ6IRT3 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ParpbpQ6IRT3 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ParpbpQ6IRT3 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ParpbpQ6IRT3 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ParpbpQ6IRT3 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ParpbpQ6IRT3 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ParpbpQ6IRT3 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ParpbpQ6IRT3 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ParpbpQ6IRT3 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ParpbpQ6IRT3 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ParpbpQ6IRT3 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ParpbpQ6IRT3 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ParpbpQ6IRT3 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ParpbpQ6IRT3 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ParpbpQ6IRT3 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ParpbpQ6IRT3 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ParpbpQ6IRT3 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ParpbpQ6IRT3 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ParpbpQ6IRT3 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ParpbpQ6IRT3 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ParpbpQ6IRT3 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ParpbpQ6IRT3 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ParpbpQ6IRT3 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ParpbpQ6IRT3 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ParpbpQ6IRT3 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ParpbpQ6IRT3 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ParpbpQ6IRT3 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ParpbpQ6IRT3 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ParpbpQ6IRT3 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ParpbpQ6IRT3 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ParpbpQ6IRT3 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ParpbpQ6IRT3 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ParpbpQ6IRT3 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ParpbpQ6IRT3 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ParpbpQ6IRT3 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ParpbpQ6IRT3 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ParpbpQ6IRT3 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ParpbpQ6IRT3 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ParpbpQ6IRT3 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ParpbpQ6IRT3 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ParpbpQ6IRT3 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ParpbpQ6IRT3 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms