Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFV6

Fndc3c1, Fibronectin type III domain containing protein 3C1, mousemouse

Predictions only

Length 1,356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc3c1Q6DFV6 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fndc3c1Q6DFV6 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fndc3c1Q6DFV6 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fndc3c1Q6DFV6 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fndc3c1Q6DFV6 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fndc3c1Q6DFV6 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Fndc3c1Q6DFV6 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Fndc3c1Q6DFV6 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Fndc3c1Q6DFV6 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Fndc3c1Q6DFV6 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Fndc3c1Q6DFV6 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Fndc3c1Q6DFV6 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Fndc3c1Q6DFV6 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Fndc3c1Q6DFV6 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Fndc3c1Q6DFV6 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Fndc3c1Q6DFV6 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Fndc3c1Q6DFV6 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
Fndc3c1Q6DFV6 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Fndc3c1Q6DFV6 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fndc3c1Q6DFV6 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fndc3c1Q6DFV6 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fndc3c1Q6DFV6 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fndc3c1Q6DFV6 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fndc3c1Q6DFV6 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fndc3c1Q6DFV6 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fndc3c1Q6DFV6 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fndc3c1Q6DFV6 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Fndc3c1Q6DFV6 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fndc3c1Q6DFV6 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fndc3c1Q6DFV6 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fndc3c1Q6DFV6 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fndc3c1Q6DFV6 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fndc3c1Q6DFV6 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fndc3c1Q6DFV6 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fndc3c1Q6DFV6 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fndc3c1Q6DFV6 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fndc3c1Q6DFV6 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fndc3c1Q6DFV6 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fndc3c1Q6DFV6 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fndc3c1Q6DFV6 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fndc3c1Q6DFV6 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fndc3c1Q6DFV6 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fndc3c1Q6DFV6 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fndc3c1Q6DFV6 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fndc3c1Q6DFV6 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fndc3c1Q6DFV6 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fndc3c1Q6DFV6 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Fndc3c1Q6DFV6 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fndc3c1Q6DFV6 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fndc3c1Q6DFV6 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fndc3c1Q6DFV6 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fndc3c1Q6DFV6 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fndc3c1Q6DFV6 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fndc3c1Q6DFV6 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fndc3c1Q6DFV6 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fndc3c1Q6DFV6 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fndc3c1Q6DFV6 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fndc3c1Q6DFV6 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fndc3c1Q6DFV6 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fndc3c1Q6DFV6 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Fndc3c1Q6DFV6 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fndc3c1Q6DFV6 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fndc3c1Q6DFV6 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fndc3c1Q6DFV6 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Fndc3c1Q6DFV6 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Fndc3c1Q6DFV6 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fndc3c1Q6DFV6 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fndc3c1Q6DFV6 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fndc3c1Q6DFV6 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fndc3c1Q6DFV6 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fndc3c1Q6DFV6 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fndc3c1Q6DFV6 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fndc3c1Q6DFV6 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fndc3c1Q6DFV6 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fndc3c1Q6DFV6 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Fndc3c1Q6DFV6 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fndc3c1Q6DFV6 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fndc3c1Q6DFV6 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fndc3c1Q6DFV6 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fndc3c1Q6DFV6 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fndc3c1Q6DFV6 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fndc3c1Q6DFV6 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fndc3c1Q6DFV6 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Fndc3c1Q6DFV6 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fndc3c1Q6DFV6 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fndc3c1Q6DFV6 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fndc3c1Q6DFV6 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fndc3c1Q6DFV6 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fndc3c1Q6DFV6 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fndc3c1Q6DFV6 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fndc3c1Q6DFV6 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Fndc3c1Q6DFV6 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Fndc3c1Q6DFV6 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Fndc3c1Q6DFV6 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Fndc3c1Q6DFV6 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Fndc3c1Q6DFV6 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Fndc3c1Q6DFV6 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Fndc3c1Q6DFV6 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Fndc3c1Q6DFV6 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Fndc3c1Q6DFV6 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.8 ms