Protein–RNA interactions for Protein: Q68EF6

Begain, Brain-enriched guanylate kinase-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 600 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BegainQ68EF6 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BegainQ68EF6 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BegainQ68EF6 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BegainQ68EF6 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BegainQ68EF6 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BegainQ68EF6 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BegainQ68EF6 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
BegainQ68EF6 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BegainQ68EF6 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BegainQ68EF6 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BegainQ68EF6 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BegainQ68EF6 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
BegainQ68EF6 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BegainQ68EF6 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BegainQ68EF6 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BegainQ68EF6 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BegainQ68EF6 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BegainQ68EF6 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
BegainQ68EF6 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
BegainQ68EF6 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
BegainQ68EF6 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BegainQ68EF6 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BegainQ68EF6 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BegainQ68EF6 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BegainQ68EF6 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BegainQ68EF6 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BegainQ68EF6 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BegainQ68EF6 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BegainQ68EF6 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BegainQ68EF6 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BegainQ68EF6 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BegainQ68EF6 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BegainQ68EF6 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BegainQ68EF6 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BegainQ68EF6 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BegainQ68EF6 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BegainQ68EF6 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BegainQ68EF6 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BegainQ68EF6 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BegainQ68EF6 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BegainQ68EF6 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BegainQ68EF6 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
BegainQ68EF6 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BegainQ68EF6 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BegainQ68EF6 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BegainQ68EF6 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
BegainQ68EF6 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BegainQ68EF6 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BegainQ68EF6 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BegainQ68EF6 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BegainQ68EF6 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BegainQ68EF6 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BegainQ68EF6 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BegainQ68EF6 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BegainQ68EF6 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BegainQ68EF6 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BegainQ68EF6 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BegainQ68EF6 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BegainQ68EF6 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
BegainQ68EF6 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BegainQ68EF6 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BegainQ68EF6 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BegainQ68EF6 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
BegainQ68EF6 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BegainQ68EF6 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BegainQ68EF6 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
BegainQ68EF6 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BegainQ68EF6 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BegainQ68EF6 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
BegainQ68EF6 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
BegainQ68EF6 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BegainQ68EF6 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
BegainQ68EF6 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BegainQ68EF6 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BegainQ68EF6 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
BegainQ68EF6 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BegainQ68EF6 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BegainQ68EF6 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BegainQ68EF6 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BegainQ68EF6 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BegainQ68EF6 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BegainQ68EF6 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BegainQ68EF6 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BegainQ68EF6 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
BegainQ68EF6 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BegainQ68EF6 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BegainQ68EF6 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
BegainQ68EF6 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
BegainQ68EF6 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
BegainQ68EF6 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
BegainQ68EF6 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BegainQ68EF6 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BegainQ68EF6 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BegainQ68EF6 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
BegainQ68EF6 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BegainQ68EF6 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BegainQ68EF6 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BegainQ68EF6 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
BegainQ68EF6 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BegainQ68EF6 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms