Protein–RNA interactions for Protein: Q64343

Abcg1, ATP-binding cassette sub-family G member 1, mousemouse

Predictions only

Length 666 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcg1Q64343 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Abcg1Q64343 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Abcg1Q64343 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Abcg1Q64343 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Abcg1Q64343 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Abcg1Q64343 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Abcg1Q64343 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Abcg1Q64343 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Abcg1Q64343 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Abcg1Q64343 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Abcg1Q64343 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Abcg1Q64343 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Abcg1Q64343 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Abcg1Q64343 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Abcg1Q64343 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Abcg1Q64343 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Abcg1Q64343 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Abcg1Q64343 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Abcg1Q64343 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Abcg1Q64343 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Abcg1Q64343 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Abcg1Q64343 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Abcg1Q64343 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Abcg1Q64343 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Abcg1Q64343 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Abcg1Q64343 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Abcg1Q64343 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Abcg1Q64343 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Abcg1Q64343 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Abcg1Q64343 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Abcg1Q64343 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Abcg1Q64343 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Abcg1Q64343 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Abcg1Q64343 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Abcg1Q64343 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Abcg1Q64343 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Abcg1Q64343 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Abcg1Q64343 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Abcg1Q64343 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Abcg1Q64343 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Abcg1Q64343 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Abcg1Q64343 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Abcg1Q64343 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Abcg1Q64343 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Abcg1Q64343 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Abcg1Q64343 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Abcg1Q64343 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Abcg1Q64343 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Abcg1Q64343 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Abcg1Q64343 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Abcg1Q64343 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Abcg1Q64343 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Abcg1Q64343 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Abcg1Q64343 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Abcg1Q64343 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Abcg1Q64343 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Abcg1Q64343 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Abcg1Q64343 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Abcg1Q64343 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Abcg1Q64343 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Abcg1Q64343 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Abcg1Q64343 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Abcg1Q64343 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Abcg1Q64343 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Abcg1Q64343 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Abcg1Q64343 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Abcg1Q64343 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Abcg1Q64343 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Abcg1Q64343 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Abcg1Q64343 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Abcg1Q64343 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Abcg1Q64343 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Abcg1Q64343 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Abcg1Q64343 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Abcg1Q64343 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Abcg1Q64343 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Abcg1Q64343 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Abcg1Q64343 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Abcg1Q64343 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Abcg1Q64343 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Abcg1Q64343 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Abcg1Q64343 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Abcg1Q64343 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Abcg1Q64343 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Abcg1Q64343 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Abcg1Q64343 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Abcg1Q64343 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Abcg1Q64343 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Abcg1Q64343 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Abcg1Q64343 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Abcg1Q64343 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Abcg1Q64343 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Abcg1Q64343 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Abcg1Q64343 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Abcg1Q64343 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Abcg1Q64343 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Abcg1Q64343 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Abcg1Q64343 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Abcg1Q64343 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Abcg1Q64343 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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