Protein–RNA interactions for Protein: Q64291

Krt12, Keratin, type I cytoskeletal 12, mousemouse

Predictions only

Length 487 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt12Q64291 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Krt12Q64291 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Krt12Q64291 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Krt12Q64291 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Krt12Q64291 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Krt12Q64291 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Krt12Q64291 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Krt12Q64291 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Krt12Q64291 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Krt12Q64291 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Krt12Q64291 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Krt12Q64291 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Krt12Q64291 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Krt12Q64291 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Krt12Q64291 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Krt12Q64291 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Krt12Q64291 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Krt12Q64291 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Krt12Q64291 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Krt12Q64291 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Krt12Q64291 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Krt12Q64291 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Krt12Q64291 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Krt12Q64291 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Krt12Q64291 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Krt12Q64291 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Krt12Q64291 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Krt12Q64291 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Krt12Q64291 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Krt12Q64291 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Krt12Q64291 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Krt12Q64291 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Krt12Q64291 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Krt12Q64291 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Krt12Q64291 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Krt12Q64291 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Krt12Q64291 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Krt12Q64291 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Krt12Q64291 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Krt12Q64291 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Krt12Q64291 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Krt12Q64291 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Krt12Q64291 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Krt12Q64291 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Krt12Q64291 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Krt12Q64291 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Krt12Q64291 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Krt12Q64291 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Krt12Q64291 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Krt12Q64291 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Krt12Q64291 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Krt12Q64291 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Krt12Q64291 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Krt12Q64291 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Krt12Q64291 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Krt12Q64291 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Krt12Q64291 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Krt12Q64291 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Krt12Q64291 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Krt12Q64291 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Krt12Q64291 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Krt12Q64291 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Krt12Q64291 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Krt12Q64291 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Krt12Q64291 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Krt12Q64291 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Krt12Q64291 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Krt12Q64291 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Krt12Q64291 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Krt12Q64291 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Krt12Q64291 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Krt12Q64291 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Krt12Q64291 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Krt12Q64291 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Krt12Q64291 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Krt12Q64291 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Krt12Q64291 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Krt12Q64291 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Krt12Q64291 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Krt12Q64291 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Krt12Q64291 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Krt12Q64291 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Krt12Q64291 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Krt12Q64291 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Krt12Q64291 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Krt12Q64291 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Krt12Q64291 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Krt12Q64291 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Krt12Q64291 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Krt12Q64291 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Krt12Q64291 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Krt12Q64291 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Krt12Q64291 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Krt12Q64291 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Krt12Q64291 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Krt12Q64291 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Krt12Q64291 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Krt12Q64291 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Krt12Q64291 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Krt12Q64291 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms