Protein–RNA interactions for Protein: Q62470

Itga3, Integrin alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga3Q62470 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Itga3Q62470 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Itga3Q62470 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Itga3Q62470 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Itga3Q62470 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Itga3Q62470 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Itga3Q62470 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Itga3Q62470 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Itga3Q62470 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Itga3Q62470 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Itga3Q62470 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Itga3Q62470 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Itga3Q62470 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Itga3Q62470 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Itga3Q62470 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Itga3Q62470 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Itga3Q62470 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Itga3Q62470 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Itga3Q62470 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Itga3Q62470 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Itga3Q62470 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Itga3Q62470 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Itga3Q62470 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Itga3Q62470 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Itga3Q62470 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Itga3Q62470 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Itga3Q62470 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Itga3Q62470 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Itga3Q62470 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Itga3Q62470 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Itga3Q62470 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Itga3Q62470 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Itga3Q62470 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Itga3Q62470 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Itga3Q62470 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Itga3Q62470 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Itga3Q62470 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Itga3Q62470 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Itga3Q62470 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Itga3Q62470 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Itga3Q62470 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Itga3Q62470 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Itga3Q62470 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Itga3Q62470 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Itga3Q62470 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Itga3Q62470 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Itga3Q62470 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Itga3Q62470 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Itga3Q62470 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Itga3Q62470 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Itga3Q62470 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Itga3Q62470 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Itga3Q62470 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Itga3Q62470 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Itga3Q62470 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Itga3Q62470 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Itga3Q62470 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Itga3Q62470 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Itga3Q62470 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Itga3Q62470 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Itga3Q62470 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Itga3Q62470 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Itga3Q62470 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Itga3Q62470 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Itga3Q62470 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Itga3Q62470 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Itga3Q62470 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Itga3Q62470 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Itga3Q62470 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Itga3Q62470 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Itga3Q62470 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Itga3Q62470 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Itga3Q62470 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Itga3Q62470 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Itga3Q62470 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Itga3Q62470 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Itga3Q62470 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Itga3Q62470 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Itga3Q62470 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Itga3Q62470 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Itga3Q62470 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Itga3Q62470 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Itga3Q62470 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Itga3Q62470 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Itga3Q62470 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Itga3Q62470 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Itga3Q62470 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Itga3Q62470 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Itga3Q62470 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Itga3Q62470 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Itga3Q62470 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Itga3Q62470 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Itga3Q62470 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Itga3Q62470 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Itga3Q62470 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Itga3Q62470 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Itga3Q62470 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Itga3Q62470 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Itga3Q62470 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Itga3Q62470 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms