Protein–RNA interactions for Protein: Q62413

Epha6, Ephrin type-A receptor 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epha6Q62413 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Epha6Q62413 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Epha6Q62413 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Epha6Q62413 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Epha6Q62413 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Epha6Q62413 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Epha6Q62413 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Epha6Q62413 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Epha6Q62413 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Epha6Q62413 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Epha6Q62413 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Epha6Q62413 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Epha6Q62413 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.08■□□□□ 0
Epha6Q62413 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Epha6Q62413 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Epha6Q62413 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Epha6Q62413 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Epha6Q62413 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Epha6Q62413 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Epha6Q62413 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Epha6Q62413 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Epha6Q62413 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Epha6Q62413 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Epha6Q62413 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Epha6Q62413 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Epha6Q62413 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Epha6Q62413 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Epha6Q62413 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Epha6Q62413 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Epha6Q62413 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Epha6Q62413 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Epha6Q62413 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Epha6Q62413 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Epha6Q62413 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Epha6Q62413 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Epha6Q62413 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Epha6Q62413 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Epha6Q62413 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Epha6Q62413 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Epha6Q62413 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Epha6Q62413 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Epha6Q62413 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Epha6Q62413 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Epha6Q62413 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Epha6Q62413 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Epha6Q62413 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Epha6Q62413 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Epha6Q62413 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Epha6Q62413 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Epha6Q62413 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Epha6Q62413 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Epha6Q62413 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Epha6Q62413 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Epha6Q62413 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Epha6Q62413 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Epha6Q62413 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Epha6Q62413 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Epha6Q62413 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Epha6Q62413 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Epha6Q62413 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Epha6Q62413 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Epha6Q62413 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Epha6Q62413 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Epha6Q62413 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Epha6Q62413 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Epha6Q62413 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Epha6Q62413 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Epha6Q62413 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Epha6Q62413 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Epha6Q62413 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Epha6Q62413 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Epha6Q62413 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Epha6Q62413 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Epha6Q62413 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Epha6Q62413 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Epha6Q62413 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Epha6Q62413 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Epha6Q62413 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Epha6Q62413 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Epha6Q62413 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Epha6Q62413 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Epha6Q62413 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Epha6Q62413 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Epha6Q62413 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Epha6Q62413 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Epha6Q62413 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Epha6Q62413 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Epha6Q62413 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Epha6Q62413 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Epha6Q62413 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Epha6Q62413 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Epha6Q62413 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Epha6Q62413 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Epha6Q62413 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Epha6Q62413 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Epha6Q62413 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Epha6Q62413 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Epha6Q62413 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Epha6Q62413 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Epha6Q62413 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms