Protein–RNA interactions for Protein: Q62159

Rhoc, Rho-related GTP-binding protein RhoC, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhocQ62159 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
RhocQ62159 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RhocQ62159 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RhocQ62159 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RhocQ62159 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RhocQ62159 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RhocQ62159 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RhocQ62159 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
RhocQ62159 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RhocQ62159 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RhocQ62159 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RhocQ62159 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RhocQ62159 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RhocQ62159 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RhocQ62159 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RhocQ62159 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
RhocQ62159 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RhocQ62159 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RhocQ62159 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RhocQ62159 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RhocQ62159 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RhocQ62159 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RhocQ62159 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RhocQ62159 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RhocQ62159 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RhocQ62159 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RhocQ62159 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RhocQ62159 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RhocQ62159 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RhocQ62159 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RhocQ62159 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RhocQ62159 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RhocQ62159 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RhocQ62159 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RhocQ62159 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RhocQ62159 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RhocQ62159 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RhocQ62159 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RhocQ62159 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RhocQ62159 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RhocQ62159 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RhocQ62159 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RhocQ62159 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RhocQ62159 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RhocQ62159 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RhocQ62159 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RhocQ62159 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RhocQ62159 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RhocQ62159 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RhocQ62159 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RhocQ62159 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RhocQ62159 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RhocQ62159 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RhocQ62159 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RhocQ62159 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RhocQ62159 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RhocQ62159 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RhocQ62159 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RhocQ62159 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RhocQ62159 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RhocQ62159 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RhocQ62159 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RhocQ62159 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RhocQ62159 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RhocQ62159 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RhocQ62159 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RhocQ62159 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RhocQ62159 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RhocQ62159 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RhocQ62159 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RhocQ62159 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RhocQ62159 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RhocQ62159 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RhocQ62159 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RhocQ62159 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RhocQ62159 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RhocQ62159 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RhocQ62159 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RhocQ62159 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RhocQ62159 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RhocQ62159 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RhocQ62159 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RhocQ62159 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RhocQ62159 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RhocQ62159 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RhocQ62159 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RhocQ62159 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RhocQ62159 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RhocQ62159 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
RhocQ62159 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
RhocQ62159 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RhocQ62159 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
RhocQ62159 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RhocQ62159 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RhocQ62159 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RhocQ62159 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RhocQ62159 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RhocQ62159 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
RhocQ62159 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RhocQ62159 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms