Protein–RNA interactions for Protein: Q61473

Sox17, Transcription factor SOX-17, mousemouse

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox17Q61473 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sox17Q61473 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sox17Q61473 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sox17Q61473 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sox17Q61473 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sox17Q61473 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sox17Q61473 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sox17Q61473 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sox17Q61473 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sox17Q61473 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sox17Q61473 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sox17Q61473 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sox17Q61473 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sox17Q61473 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sox17Q61473 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sox17Q61473 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sox17Q61473 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sox17Q61473 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sox17Q61473 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sox17Q61473 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sox17Q61473 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sox17Q61473 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sox17Q61473 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sox17Q61473 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sox17Q61473 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sox17Q61473 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sox17Q61473 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sox17Q61473 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sox17Q61473 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sox17Q61473 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sox17Q61473 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sox17Q61473 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sox17Q61473 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sox17Q61473 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sox17Q61473 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sox17Q61473 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sox17Q61473 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sox17Q61473 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sox17Q61473 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sox17Q61473 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sox17Q61473 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sox17Q61473 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sox17Q61473 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sox17Q61473 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sox17Q61473 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sox17Q61473 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sox17Q61473 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sox17Q61473 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sox17Q61473 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sox17Q61473 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sox17Q61473 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sox17Q61473 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sox17Q61473 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sox17Q61473 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sox17Q61473 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Sox17Q61473 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sox17Q61473 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sox17Q61473 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sox17Q61473 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sox17Q61473 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sox17Q61473 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sox17Q61473 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sox17Q61473 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sox17Q61473 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sox17Q61473 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sox17Q61473 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sox17Q61473 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sox17Q61473 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sox17Q61473 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sox17Q61473 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Sox17Q61473 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sox17Q61473 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sox17Q61473 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sox17Q61473 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sox17Q61473 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sox17Q61473 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sox17Q61473 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sox17Q61473 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Sox17Q61473 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sox17Q61473 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sox17Q61473 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sox17Q61473 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sox17Q61473 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sox17Q61473 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sox17Q61473 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Sox17Q61473 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Sox17Q61473 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sox17Q61473 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sox17Q61473 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sox17Q61473 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sox17Q61473 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sox17Q61473 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sox17Q61473 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sox17Q61473 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sox17Q61473 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sox17Q61473 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sox17Q61473 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sox17Q61473 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sox17Q61473 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sox17Q61473 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms