Protein–RNA interactions for Protein: Q60632

Nr2f1, COUP transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr2f1Q60632 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nr2f1Q60632 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nr2f1Q60632 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nr2f1Q60632 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nr2f1Q60632 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nr2f1Q60632 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nr2f1Q60632 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nr2f1Q60632 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Nr2f1Q60632 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nr2f1Q60632 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nr2f1Q60632 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nr2f1Q60632 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nr2f1Q60632 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nr2f1Q60632 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nr2f1Q60632 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nr2f1Q60632 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nr2f1Q60632 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nr2f1Q60632 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nr2f1Q60632 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nr2f1Q60632 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nr2f1Q60632 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nr2f1Q60632 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nr2f1Q60632 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nr2f1Q60632 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nr2f1Q60632 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nr2f1Q60632 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nr2f1Q60632 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nr2f1Q60632 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Nr2f1Q60632 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nr2f1Q60632 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nr2f1Q60632 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nr2f1Q60632 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nr2f1Q60632 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nr2f1Q60632 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nr2f1Q60632 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Nr2f1Q60632 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nr2f1Q60632 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nr2f1Q60632 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Nr2f1Q60632 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nr2f1Q60632 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nr2f1Q60632 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nr2f1Q60632 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nr2f1Q60632 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nr2f1Q60632 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nr2f1Q60632 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nr2f1Q60632 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nr2f1Q60632 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nr2f1Q60632 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nr2f1Q60632 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nr2f1Q60632 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nr2f1Q60632 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nr2f1Q60632 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nr2f1Q60632 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nr2f1Q60632 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nr2f1Q60632 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nr2f1Q60632 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nr2f1Q60632 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nr2f1Q60632 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nr2f1Q60632 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nr2f1Q60632 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nr2f1Q60632 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nr2f1Q60632 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nr2f1Q60632 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nr2f1Q60632 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nr2f1Q60632 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Nr2f1Q60632 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Nr2f1Q60632 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Nr2f1Q60632 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Nr2f1Q60632 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Nr2f1Q60632 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nr2f1Q60632 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nr2f1Q60632 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nr2f1Q60632 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nr2f1Q60632 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nr2f1Q60632 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nr2f1Q60632 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Nr2f1Q60632 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nr2f1Q60632 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nr2f1Q60632 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nr2f1Q60632 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nr2f1Q60632 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nr2f1Q60632 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nr2f1Q60632 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nr2f1Q60632 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nr2f1Q60632 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nr2f1Q60632 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nr2f1Q60632 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nr2f1Q60632 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nr2f1Q60632 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nr2f1Q60632 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nr2f1Q60632 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Nr2f1Q60632 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nr2f1Q60632 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nr2f1Q60632 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nr2f1Q60632 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nr2f1Q60632 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nr2f1Q60632 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nr2f1Q60632 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Nr2f1Q60632 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nr2f1Q60632 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms