Protein–RNA interactions for Protein: Q5UBV8

Tnfsf15, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 15, mousemouse

Predictions only

Length 252 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf15Q5UBV8 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tnfsf15Q5UBV8 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tnfsf15Q5UBV8 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tnfsf15Q5UBV8 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tnfsf15Q5UBV8 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tnfsf15Q5UBV8 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tnfsf15Q5UBV8 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Tnfsf15Q5UBV8 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tnfsf15Q5UBV8 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tnfsf15Q5UBV8 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tnfsf15Q5UBV8 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tnfsf15Q5UBV8 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tnfsf15Q5UBV8 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tnfsf15Q5UBV8 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tnfsf15Q5UBV8 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tnfsf15Q5UBV8 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Tnfsf15Q5UBV8 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tnfsf15Q5UBV8 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tnfsf15Q5UBV8 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Tnfsf15Q5UBV8 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tnfsf15Q5UBV8 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tnfsf15Q5UBV8 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Tnfsf15Q5UBV8 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tnfsf15Q5UBV8 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tnfsf15Q5UBV8 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tnfsf15Q5UBV8 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tnfsf15Q5UBV8 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tnfsf15Q5UBV8 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tnfsf15Q5UBV8 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tnfsf15Q5UBV8 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tnfsf15Q5UBV8 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tnfsf15Q5UBV8 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tnfsf15Q5UBV8 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tnfsf15Q5UBV8 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tnfsf15Q5UBV8 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tnfsf15Q5UBV8 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Tnfsf15Q5UBV8 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tnfsf15Q5UBV8 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tnfsf15Q5UBV8 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tnfsf15Q5UBV8 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tnfsf15Q5UBV8 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tnfsf15Q5UBV8 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tnfsf15Q5UBV8 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tnfsf15Q5UBV8 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tnfsf15Q5UBV8 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tnfsf15Q5UBV8 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tnfsf15Q5UBV8 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tnfsf15Q5UBV8 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tnfsf15Q5UBV8 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tnfsf15Q5UBV8 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tnfsf15Q5UBV8 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tnfsf15Q5UBV8 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tnfsf15Q5UBV8 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tnfsf15Q5UBV8 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tnfsf15Q5UBV8 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tnfsf15Q5UBV8 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tnfsf15Q5UBV8 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tnfsf15Q5UBV8 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tnfsf15Q5UBV8 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tnfsf15Q5UBV8 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tnfsf15Q5UBV8 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tnfsf15Q5UBV8 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tnfsf15Q5UBV8 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tnfsf15Q5UBV8 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tnfsf15Q5UBV8 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tnfsf15Q5UBV8 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tnfsf15Q5UBV8 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tnfsf15Q5UBV8 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tnfsf15Q5UBV8 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tnfsf15Q5UBV8 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tnfsf15Q5UBV8 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tnfsf15Q5UBV8 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tnfsf15Q5UBV8 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tnfsf15Q5UBV8 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tnfsf15Q5UBV8 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tnfsf15Q5UBV8 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tnfsf15Q5UBV8 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tnfsf15Q5UBV8 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tnfsf15Q5UBV8 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tnfsf15Q5UBV8 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tnfsf15Q5UBV8 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tnfsf15Q5UBV8 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tnfsf15Q5UBV8 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tnfsf15Q5UBV8 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tnfsf15Q5UBV8 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tnfsf15Q5UBV8 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tnfsf15Q5UBV8 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tnfsf15Q5UBV8 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tnfsf15Q5UBV8 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Tnfsf15Q5UBV8 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tnfsf15Q5UBV8 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tnfsf15Q5UBV8 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tnfsf15Q5UBV8 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tnfsf15Q5UBV8 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tnfsf15Q5UBV8 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tnfsf15Q5UBV8 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Tnfsf15Q5UBV8 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Tnfsf15Q5UBV8 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tnfsf15Q5UBV8 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tnfsf15Q5UBV8 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms