Protein–RNA interactions for Protein: Q5SVD5

Vmn1r196, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

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Length 301 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r196Q5SVD5 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Vmn1r196Q5SVD5 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Vmn1r196Q5SVD5 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Vmn1r196Q5SVD5 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Vmn1r196Q5SVD5 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Vmn1r196Q5SVD5 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Vmn1r196Q5SVD5 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Vmn1r196Q5SVD5 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Vmn1r196Q5SVD5 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Vmn1r196Q5SVD5 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Vmn1r196Q5SVD5 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Vmn1r196Q5SVD5 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Vmn1r196Q5SVD5 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Vmn1r196Q5SVD5 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Vmn1r196Q5SVD5 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Vmn1r196Q5SVD5 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Vmn1r196Q5SVD5 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Vmn1r196Q5SVD5 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Vmn1r196Q5SVD5 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Vmn1r196Q5SVD5 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Vmn1r196Q5SVD5 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Vmn1r196Q5SVD5 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Vmn1r196Q5SVD5 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Vmn1r196Q5SVD5 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Vmn1r196Q5SVD5 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Vmn1r196Q5SVD5 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Vmn1r196Q5SVD5 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Vmn1r196Q5SVD5 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Vmn1r196Q5SVD5 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Vmn1r196Q5SVD5 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Vmn1r196Q5SVD5 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Vmn1r196Q5SVD5 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Vmn1r196Q5SVD5 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Vmn1r196Q5SVD5 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Vmn1r196Q5SVD5 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Vmn1r196Q5SVD5 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Vmn1r196Q5SVD5 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Vmn1r196Q5SVD5 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Vmn1r196Q5SVD5 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Vmn1r196Q5SVD5 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Vmn1r196Q5SVD5 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Vmn1r196Q5SVD5 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vmn1r196Q5SVD5 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Vmn1r196Q5SVD5 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vmn1r196Q5SVD5 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vmn1r196Q5SVD5 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Vmn1r196Q5SVD5 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vmn1r196Q5SVD5 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Vmn1r196Q5SVD5 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vmn1r196Q5SVD5 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vmn1r196Q5SVD5 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vmn1r196Q5SVD5 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Vmn1r196Q5SVD5 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vmn1r196Q5SVD5 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vmn1r196Q5SVD5 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Vmn1r196Q5SVD5 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Vmn1r196Q5SVD5 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vmn1r196Q5SVD5 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vmn1r196Q5SVD5 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vmn1r196Q5SVD5 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vmn1r196Q5SVD5 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vmn1r196Q5SVD5 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vmn1r196Q5SVD5 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vmn1r196Q5SVD5 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vmn1r196Q5SVD5 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vmn1r196Q5SVD5 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vmn1r196Q5SVD5 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vmn1r196Q5SVD5 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vmn1r196Q5SVD5 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vmn1r196Q5SVD5 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vmn1r196Q5SVD5 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vmn1r196Q5SVD5 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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