Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCF2

Trappc1, Trafficking protein particle complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc1Q5NCF2 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Trappc1Q5NCF2 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Trappc1Q5NCF2 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trappc1Q5NCF2 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trappc1Q5NCF2 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trappc1Q5NCF2 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trappc1Q5NCF2 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trappc1Q5NCF2 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trappc1Q5NCF2 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trappc1Q5NCF2 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trappc1Q5NCF2 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trappc1Q5NCF2 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Trappc1Q5NCF2 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trappc1Q5NCF2 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trappc1Q5NCF2 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trappc1Q5NCF2 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trappc1Q5NCF2 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trappc1Q5NCF2 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trappc1Q5NCF2 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trappc1Q5NCF2 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trappc1Q5NCF2 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trappc1Q5NCF2 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trappc1Q5NCF2 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trappc1Q5NCF2 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trappc1Q5NCF2 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trappc1Q5NCF2 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trappc1Q5NCF2 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trappc1Q5NCF2 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trappc1Q5NCF2 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trappc1Q5NCF2 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trappc1Q5NCF2 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trappc1Q5NCF2 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trappc1Q5NCF2 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trappc1Q5NCF2 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trappc1Q5NCF2 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trappc1Q5NCF2 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trappc1Q5NCF2 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trappc1Q5NCF2 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trappc1Q5NCF2 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trappc1Q5NCF2 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trappc1Q5NCF2 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trappc1Q5NCF2 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trappc1Q5NCF2 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trappc1Q5NCF2 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trappc1Q5NCF2 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trappc1Q5NCF2 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trappc1Q5NCF2 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trappc1Q5NCF2 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trappc1Q5NCF2 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trappc1Q5NCF2 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trappc1Q5NCF2 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trappc1Q5NCF2 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trappc1Q5NCF2 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trappc1Q5NCF2 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trappc1Q5NCF2 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trappc1Q5NCF2 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trappc1Q5NCF2 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trappc1Q5NCF2 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trappc1Q5NCF2 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trappc1Q5NCF2 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trappc1Q5NCF2 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trappc1Q5NCF2 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trappc1Q5NCF2 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trappc1Q5NCF2 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trappc1Q5NCF2 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trappc1Q5NCF2 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trappc1Q5NCF2 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trappc1Q5NCF2 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trappc1Q5NCF2 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trappc1Q5NCF2 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trappc1Q5NCF2 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trappc1Q5NCF2 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trappc1Q5NCF2 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trappc1Q5NCF2 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trappc1Q5NCF2 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trappc1Q5NCF2 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trappc1Q5NCF2 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trappc1Q5NCF2 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trappc1Q5NCF2 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trappc1Q5NCF2 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trappc1Q5NCF2 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trappc1Q5NCF2 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trappc1Q5NCF2 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trappc1Q5NCF2 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trappc1Q5NCF2 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trappc1Q5NCF2 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trappc1Q5NCF2 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trappc1Q5NCF2 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trappc1Q5NCF2 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trappc1Q5NCF2 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trappc1Q5NCF2 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trappc1Q5NCF2 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trappc1Q5NCF2 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trappc1Q5NCF2 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trappc1Q5NCF2 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trappc1Q5NCF2 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trappc1Q5NCF2 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trappc1Q5NCF2 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trappc1Q5NCF2 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trappc1Q5NCF2 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms