Protein–RNA interactions for Protein: Q3V016

Hipk4, Homeodomain-interacting protein kinase 4, mousemouse

Predictions only

Length 616 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hipk4Q3V016 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hipk4Q3V016 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hipk4Q3V016 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hipk4Q3V016 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hipk4Q3V016 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hipk4Q3V016 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hipk4Q3V016 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hipk4Q3V016 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hipk4Q3V016 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hipk4Q3V016 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hipk4Q3V016 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hipk4Q3V016 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hipk4Q3V016 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hipk4Q3V016 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hipk4Q3V016 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hipk4Q3V016 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hipk4Q3V016 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hipk4Q3V016 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hipk4Q3V016 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hipk4Q3V016 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hipk4Q3V016 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hipk4Q3V016 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hipk4Q3V016 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hipk4Q3V016 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hipk4Q3V016 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hipk4Q3V016 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hipk4Q3V016 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hipk4Q3V016 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hipk4Q3V016 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hipk4Q3V016 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hipk4Q3V016 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Hipk4Q3V016 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hipk4Q3V016 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hipk4Q3V016 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hipk4Q3V016 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hipk4Q3V016 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hipk4Q3V016 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hipk4Q3V016 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hipk4Q3V016 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Hipk4Q3V016 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hipk4Q3V016 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hipk4Q3V016 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hipk4Q3V016 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hipk4Q3V016 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hipk4Q3V016 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Hipk4Q3V016 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hipk4Q3V016 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hipk4Q3V016 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Hipk4Q3V016 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Hipk4Q3V016 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Hipk4Q3V016 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Hipk4Q3V016 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Hipk4Q3V016 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Hipk4Q3V016 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hipk4Q3V016 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hipk4Q3V016 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hipk4Q3V016 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hipk4Q3V016 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hipk4Q3V016 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hipk4Q3V016 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hipk4Q3V016 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hipk4Q3V016 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hipk4Q3V016 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hipk4Q3V016 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hipk4Q3V016 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hipk4Q3V016 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hipk4Q3V016 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hipk4Q3V016 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hipk4Q3V016 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hipk4Q3V016 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hipk4Q3V016 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hipk4Q3V016 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hipk4Q3V016 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hipk4Q3V016 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hipk4Q3V016 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hipk4Q3V016 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hipk4Q3V016 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hipk4Q3V016 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hipk4Q3V016 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hipk4Q3V016 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hipk4Q3V016 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hipk4Q3V016 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hipk4Q3V016 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hipk4Q3V016 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hipk4Q3V016 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hipk4Q3V016 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hipk4Q3V016 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hipk4Q3V016 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hipk4Q3V016 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hipk4Q3V016 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hipk4Q3V016 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hipk4Q3V016 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hipk4Q3V016 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hipk4Q3V016 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hipk4Q3V016 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hipk4Q3V016 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hipk4Q3V016 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hipk4Q3V016 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hipk4Q3V016 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hipk4Q3V016 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms