Protein–RNA interactions for Protein: Q3UUV9

H2-Eb2, Histocompatibility 2, class II antigen E beta2, mousemouse

Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb2Q3UUV9 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2-Eb2Q3UUV9 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2-Eb2Q3UUV9 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
H2-Eb2Q3UUV9 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
H2-Eb2Q3UUV9 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2-Eb2Q3UUV9 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
H2-Eb2Q3UUV9 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2-Eb2Q3UUV9 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2-Eb2Q3UUV9 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2-Eb2Q3UUV9 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2-Eb2Q3UUV9 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2-Eb2Q3UUV9 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2-Eb2Q3UUV9 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2-Eb2Q3UUV9 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2-Eb2Q3UUV9 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2-Eb2Q3UUV9 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2-Eb2Q3UUV9 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2-Eb2Q3UUV9 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2-Eb2Q3UUV9 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2-Eb2Q3UUV9 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2-Eb2Q3UUV9 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2-Eb2Q3UUV9 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2-Eb2Q3UUV9 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2-Eb2Q3UUV9 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2-Eb2Q3UUV9 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2-Eb2Q3UUV9 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2-Eb2Q3UUV9 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2-Eb2Q3UUV9 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2-Eb2Q3UUV9 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2-Eb2Q3UUV9 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2-Eb2Q3UUV9 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2-Eb2Q3UUV9 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2-Eb2Q3UUV9 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
H2-Eb2Q3UUV9 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2-Eb2Q3UUV9 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2-Eb2Q3UUV9 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2-Eb2Q3UUV9 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2-Eb2Q3UUV9 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2-Eb2Q3UUV9 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2-Eb2Q3UUV9 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2-Eb2Q3UUV9 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
H2-Eb2Q3UUV9 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2-Eb2Q3UUV9 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2-Eb2Q3UUV9 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2-Eb2Q3UUV9 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2-Eb2Q3UUV9 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2-Eb2Q3UUV9 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2-Eb2Q3UUV9 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2-Eb2Q3UUV9 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2-Eb2Q3UUV9 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2-Eb2Q3UUV9 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2-Eb2Q3UUV9 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2-Eb2Q3UUV9 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2-Eb2Q3UUV9 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2-Eb2Q3UUV9 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2-Eb2Q3UUV9 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2-Eb2Q3UUV9 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2-Eb2Q3UUV9 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2-Eb2Q3UUV9 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2-Eb2Q3UUV9 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2-Eb2Q3UUV9 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2-Eb2Q3UUV9 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2-Eb2Q3UUV9 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2-Eb2Q3UUV9 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2-Eb2Q3UUV9 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2-Eb2Q3UUV9 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2-Eb2Q3UUV9 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2-Eb2Q3UUV9 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
H2-Eb2Q3UUV9 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2-Eb2Q3UUV9 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2-Eb2Q3UUV9 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2-Eb2Q3UUV9 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2-Eb2Q3UUV9 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2-Eb2Q3UUV9 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2-Eb2Q3UUV9 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2-Eb2Q3UUV9 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
H2-Eb2Q3UUV9 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2-Eb2Q3UUV9 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2-Eb2Q3UUV9 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2-Eb2Q3UUV9 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2-Eb2Q3UUV9 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2-Eb2Q3UUV9 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2-Eb2Q3UUV9 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2-Eb2Q3UUV9 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2-Eb2Q3UUV9 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2-Eb2Q3UUV9 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2-Eb2Q3UUV9 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2-Eb2Q3UUV9 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2-Eb2Q3UUV9 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2-Eb2Q3UUV9 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2-Eb2Q3UUV9 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2-Eb2Q3UUV9 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2-Eb2Q3UUV9 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2-Eb2Q3UUV9 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2-Eb2Q3UUV9 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2-Eb2Q3UUV9 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2-Eb2Q3UUV9 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2-Eb2Q3UUV9 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2-Eb2Q3UUV9 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2-Eb2Q3UUV9 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms