Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPV3

E130208F15Rik, RIKEN cDNA E130208F15 gene, mousemouse

Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E130208F15RikQ3UPV3 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
E130208F15RikQ3UPV3 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
E130208F15RikQ3UPV3 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
E130208F15RikQ3UPV3 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
E130208F15RikQ3UPV3 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
E130208F15RikQ3UPV3 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
E130208F15RikQ3UPV3 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
E130208F15RikQ3UPV3 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
E130208F15RikQ3UPV3 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
E130208F15RikQ3UPV3 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
E130208F15RikQ3UPV3 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
E130208F15RikQ3UPV3 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
E130208F15RikQ3UPV3 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
E130208F15RikQ3UPV3 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
E130208F15RikQ3UPV3 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
E130208F15RikQ3UPV3 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
E130208F15RikQ3UPV3 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
E130208F15RikQ3UPV3 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
E130208F15RikQ3UPV3 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
E130208F15RikQ3UPV3 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
E130208F15RikQ3UPV3 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
E130208F15RikQ3UPV3 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
E130208F15RikQ3UPV3 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
E130208F15RikQ3UPV3 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
E130208F15RikQ3UPV3 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
E130208F15RikQ3UPV3 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
E130208F15RikQ3UPV3 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
E130208F15RikQ3UPV3 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
E130208F15RikQ3UPV3 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
E130208F15RikQ3UPV3 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
E130208F15RikQ3UPV3 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
E130208F15RikQ3UPV3 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
E130208F15RikQ3UPV3 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
E130208F15RikQ3UPV3 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
E130208F15RikQ3UPV3 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
E130208F15RikQ3UPV3 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
E130208F15RikQ3UPV3 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
E130208F15RikQ3UPV3 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
E130208F15RikQ3UPV3 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
E130208F15RikQ3UPV3 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
E130208F15RikQ3UPV3 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
E130208F15RikQ3UPV3 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
E130208F15RikQ3UPV3 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
E130208F15RikQ3UPV3 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
E130208F15RikQ3UPV3 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
E130208F15RikQ3UPV3 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
E130208F15RikQ3UPV3 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
E130208F15RikQ3UPV3 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
E130208F15RikQ3UPV3 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
E130208F15RikQ3UPV3 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
E130208F15RikQ3UPV3 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
E130208F15RikQ3UPV3 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
E130208F15RikQ3UPV3 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
E130208F15RikQ3UPV3 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
E130208F15RikQ3UPV3 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
E130208F15RikQ3UPV3 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
E130208F15RikQ3UPV3 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
E130208F15RikQ3UPV3 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
E130208F15RikQ3UPV3 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
E130208F15RikQ3UPV3 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
E130208F15RikQ3UPV3 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
E130208F15RikQ3UPV3 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
E130208F15RikQ3UPV3 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
E130208F15RikQ3UPV3 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
E130208F15RikQ3UPV3 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
E130208F15RikQ3UPV3 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
E130208F15RikQ3UPV3 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
E130208F15RikQ3UPV3 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
E130208F15RikQ3UPV3 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
E130208F15RikQ3UPV3 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
E130208F15RikQ3UPV3 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
E130208F15RikQ3UPV3 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
E130208F15RikQ3UPV3 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
E130208F15RikQ3UPV3 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
E130208F15RikQ3UPV3 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
E130208F15RikQ3UPV3 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
E130208F15RikQ3UPV3 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
E130208F15RikQ3UPV3 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
E130208F15RikQ3UPV3 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
E130208F15RikQ3UPV3 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
E130208F15RikQ3UPV3 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
E130208F15RikQ3UPV3 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
E130208F15RikQ3UPV3 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
E130208F15RikQ3UPV3 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
E130208F15RikQ3UPV3 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
E130208F15RikQ3UPV3 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
E130208F15RikQ3UPV3 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
E130208F15RikQ3UPV3 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
E130208F15RikQ3UPV3 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
E130208F15RikQ3UPV3 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
E130208F15RikQ3UPV3 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
E130208F15RikQ3UPV3 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
E130208F15RikQ3UPV3 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
E130208F15RikQ3UPV3 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
E130208F15RikQ3UPV3 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
E130208F15RikQ3UPV3 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
E130208F15RikQ3UPV3 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
E130208F15RikQ3UPV3 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
E130208F15RikQ3UPV3 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
E130208F15RikQ3UPV3 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms