Protein–RNA interactions for Protein: Q3UM18

Lsg1, Large subunit GTPase 1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 644 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsg1Q3UM18 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lsg1Q3UM18 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lsg1Q3UM18 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lsg1Q3UM18 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lsg1Q3UM18 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lsg1Q3UM18 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lsg1Q3UM18 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lsg1Q3UM18 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lsg1Q3UM18 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lsg1Q3UM18 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lsg1Q3UM18 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lsg1Q3UM18 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lsg1Q3UM18 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lsg1Q3UM18 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lsg1Q3UM18 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lsg1Q3UM18 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lsg1Q3UM18 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lsg1Q3UM18 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Lsg1Q3UM18 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lsg1Q3UM18 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lsg1Q3UM18 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lsg1Q3UM18 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lsg1Q3UM18 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lsg1Q3UM18 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lsg1Q3UM18 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Lsg1Q3UM18 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lsg1Q3UM18 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lsg1Q3UM18 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lsg1Q3UM18 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lsg1Q3UM18 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lsg1Q3UM18 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lsg1Q3UM18 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lsg1Q3UM18 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lsg1Q3UM18 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lsg1Q3UM18 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lsg1Q3UM18 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lsg1Q3UM18 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lsg1Q3UM18 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lsg1Q3UM18 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lsg1Q3UM18 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lsg1Q3UM18 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lsg1Q3UM18 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lsg1Q3UM18 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lsg1Q3UM18 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Lsg1Q3UM18 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lsg1Q3UM18 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lsg1Q3UM18 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lsg1Q3UM18 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lsg1Q3UM18 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lsg1Q3UM18 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lsg1Q3UM18 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lsg1Q3UM18 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lsg1Q3UM18 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lsg1Q3UM18 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lsg1Q3UM18 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lsg1Q3UM18 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lsg1Q3UM18 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lsg1Q3UM18 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lsg1Q3UM18 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lsg1Q3UM18 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lsg1Q3UM18 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lsg1Q3UM18 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lsg1Q3UM18 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lsg1Q3UM18 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lsg1Q3UM18 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lsg1Q3UM18 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lsg1Q3UM18 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lsg1Q3UM18 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lsg1Q3UM18 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lsg1Q3UM18 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lsg1Q3UM18 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lsg1Q3UM18 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lsg1Q3UM18 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lsg1Q3UM18 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lsg1Q3UM18 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lsg1Q3UM18 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lsg1Q3UM18 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lsg1Q3UM18 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lsg1Q3UM18 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lsg1Q3UM18 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lsg1Q3UM18 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lsg1Q3UM18 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lsg1Q3UM18 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lsg1Q3UM18 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lsg1Q3UM18 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lsg1Q3UM18 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lsg1Q3UM18 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lsg1Q3UM18 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lsg1Q3UM18 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lsg1Q3UM18 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lsg1Q3UM18 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lsg1Q3UM18 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lsg1Q3UM18 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lsg1Q3UM18 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lsg1Q3UM18 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lsg1Q3UM18 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lsg1Q3UM18 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lsg1Q3UM18 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lsg1Q3UM18 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lsg1Q3UM18 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms