Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHI0

Ccser2, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 833 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccser2Q3UHI0 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccser2Q3UHI0 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccser2Q3UHI0 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccser2Q3UHI0 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccser2Q3UHI0 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccser2Q3UHI0 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccser2Q3UHI0 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccser2Q3UHI0 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccser2Q3UHI0 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccser2Q3UHI0 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccser2Q3UHI0 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccser2Q3UHI0 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccser2Q3UHI0 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccser2Q3UHI0 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccser2Q3UHI0 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccser2Q3UHI0 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccser2Q3UHI0 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccser2Q3UHI0 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccser2Q3UHI0 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccser2Q3UHI0 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccser2Q3UHI0 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccser2Q3UHI0 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccser2Q3UHI0 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccser2Q3UHI0 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccser2Q3UHI0 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccser2Q3UHI0 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccser2Q3UHI0 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccser2Q3UHI0 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccser2Q3UHI0 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccser2Q3UHI0 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccser2Q3UHI0 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccser2Q3UHI0 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccser2Q3UHI0 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccser2Q3UHI0 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccser2Q3UHI0 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccser2Q3UHI0 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccser2Q3UHI0 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccser2Q3UHI0 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccser2Q3UHI0 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccser2Q3UHI0 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccser2Q3UHI0 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccser2Q3UHI0 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccser2Q3UHI0 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccser2Q3UHI0 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccser2Q3UHI0 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccser2Q3UHI0 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccser2Q3UHI0 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccser2Q3UHI0 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccser2Q3UHI0 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccser2Q3UHI0 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccser2Q3UHI0 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccser2Q3UHI0 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccser2Q3UHI0 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccser2Q3UHI0 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccser2Q3UHI0 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccser2Q3UHI0 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccser2Q3UHI0 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccser2Q3UHI0 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccser2Q3UHI0 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccser2Q3UHI0 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccser2Q3UHI0 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccser2Q3UHI0 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccser2Q3UHI0 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccser2Q3UHI0 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccser2Q3UHI0 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccser2Q3UHI0 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccser2Q3UHI0 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccser2Q3UHI0 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccser2Q3UHI0 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccser2Q3UHI0 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccser2Q3UHI0 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccser2Q3UHI0 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccser2Q3UHI0 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccser2Q3UHI0 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccser2Q3UHI0 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccser2Q3UHI0 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccser2Q3UHI0 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccser2Q3UHI0 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccser2Q3UHI0 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccser2Q3UHI0 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccser2Q3UHI0 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccser2Q3UHI0 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccser2Q3UHI0 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccser2Q3UHI0 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccser2Q3UHI0 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccser2Q3UHI0 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccser2Q3UHI0 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccser2Q3UHI0 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Ccser2Q3UHI0 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccser2Q3UHI0 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccser2Q3UHI0 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccser2Q3UHI0 Gm26826-201ENSMUST00000181317 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccser2Q3UHI0 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccser2Q3UHI0 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccser2Q3UHI0 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccser2Q3UHI0 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccser2Q3UHI0 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccser2Q3UHI0 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccser2Q3UHI0 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccser2Q3UHI0 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms