Protein–RNA interactions for Protein: Q3U595

UPF0545 protein C22orf39 homolog, mousemouse

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Length 105 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U595 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q3U595 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q3U595 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q3U595 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q3U595 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Q3U595 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q3U595 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q3U595 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q3U595 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Q3U595 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q3U595 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q3U595 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q3U595 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q3U595 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q3U595 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q3U595 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q3U595 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q3U595 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q3U595 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q3U595 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q3U595 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q3U595 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q3U595 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q3U595 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q3U595 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q3U595 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q3U595 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q3U595 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q3U595 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q3U595 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q3U595 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q3U595 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q3U595 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q3U595 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q3U595 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q3U595 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q3U595 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q3U595 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q3U595 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q3U595 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q3U595 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q3U595 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q3U595 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q3U595 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q3U595 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q3U595 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q3U595 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q3U595 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q3U595 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q3U595 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Q3U595 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Q3U595 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Q3U595 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Q3U595 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Q3U595 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Q3U595 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Q3U595 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Q3U595 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Q3U595 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Q3U595 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Q3U595 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Q3U595 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Q3U595 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Q3U595 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Q3U595 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Q3U595 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Q3U595 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Q3U595 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Q3U595 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Q3U595 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Q3U595 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Q3U595 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Q3U595 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Q3U595 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Q3U595 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Q3U595 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Q3U595 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Q3U595 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Q3U595 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Q3U595 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Q3U595 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Q3U595 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Q3U595 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Q3U595 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Q3U595 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Q3U595 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Q3U595 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Q3U595 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Q3U595 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Q3U595 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Q3U595 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Q3U595 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Q3U595 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Q3U595 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Q3U595 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Q3U595 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Q3U595 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Q3U595 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Q3U595 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Q3U595 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
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