Protein–RNA interactions for Protein: Q3U4B1

Ssbp4, Single stranded DNA binding protein 4, isoform CRA_b, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssbp4Q3U4B1 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ssbp4Q3U4B1 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Ssbp4Q3U4B1 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ssbp4Q3U4B1 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ssbp4Q3U4B1 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ssbp4Q3U4B1 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ssbp4Q3U4B1 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ssbp4Q3U4B1 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ssbp4Q3U4B1 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Ssbp4Q3U4B1 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ssbp4Q3U4B1 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ssbp4Q3U4B1 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ssbp4Q3U4B1 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ssbp4Q3U4B1 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Ssbp4Q3U4B1 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ssbp4Q3U4B1 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ssbp4Q3U4B1 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ssbp4Q3U4B1 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ssbp4Q3U4B1 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ssbp4Q3U4B1 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ssbp4Q3U4B1 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ssbp4Q3U4B1 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ssbp4Q3U4B1 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ssbp4Q3U4B1 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ssbp4Q3U4B1 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ssbp4Q3U4B1 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ssbp4Q3U4B1 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Ssbp4Q3U4B1 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ssbp4Q3U4B1 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ssbp4Q3U4B1 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ssbp4Q3U4B1 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ssbp4Q3U4B1 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Ssbp4Q3U4B1 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ssbp4Q3U4B1 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ssbp4Q3U4B1 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ssbp4Q3U4B1 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ssbp4Q3U4B1 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ssbp4Q3U4B1 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ssbp4Q3U4B1 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ssbp4Q3U4B1 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ssbp4Q3U4B1 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ssbp4Q3U4B1 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ssbp4Q3U4B1 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ssbp4Q3U4B1 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ssbp4Q3U4B1 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ssbp4Q3U4B1 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ssbp4Q3U4B1 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ssbp4Q3U4B1 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Ssbp4Q3U4B1 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ssbp4Q3U4B1 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ssbp4Q3U4B1 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ssbp4Q3U4B1 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ssbp4Q3U4B1 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ssbp4Q3U4B1 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ssbp4Q3U4B1 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ssbp4Q3U4B1 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ssbp4Q3U4B1 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ssbp4Q3U4B1 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ssbp4Q3U4B1 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ssbp4Q3U4B1 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ssbp4Q3U4B1 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ssbp4Q3U4B1 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ssbp4Q3U4B1 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ssbp4Q3U4B1 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ssbp4Q3U4B1 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ssbp4Q3U4B1 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ssbp4Q3U4B1 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ssbp4Q3U4B1 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Ssbp4Q3U4B1 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ssbp4Q3U4B1 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ssbp4Q3U4B1 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ssbp4Q3U4B1 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ssbp4Q3U4B1 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ssbp4Q3U4B1 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ssbp4Q3U4B1 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Ssbp4Q3U4B1 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ssbp4Q3U4B1 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ssbp4Q3U4B1 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ssbp4Q3U4B1 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ssbp4Q3U4B1 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ssbp4Q3U4B1 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ssbp4Q3U4B1 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Ssbp4Q3U4B1 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ssbp4Q3U4B1 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Ssbp4Q3U4B1 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ssbp4Q3U4B1 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ssbp4Q3U4B1 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Ssbp4Q3U4B1 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ssbp4Q3U4B1 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ssbp4Q3U4B1 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ssbp4Q3U4B1 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ssbp4Q3U4B1 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ssbp4Q3U4B1 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ssbp4Q3U4B1 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ssbp4Q3U4B1 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ssbp4Q3U4B1 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ssbp4Q3U4B1 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ssbp4Q3U4B1 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ssbp4Q3U4B1 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ssbp4Q3U4B1 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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