Protein–RNA interactions for Protein: Q3TCJ8

Ccdc69, Coiled-coil domain-containing protein 69, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc69Q3TCJ8 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc69Q3TCJ8 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc69Q3TCJ8 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc69Q3TCJ8 Sgk1-213ENSMUST00000164659 2602 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc69Q3TCJ8 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc69Q3TCJ8 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc69Q3TCJ8 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc69Q3TCJ8 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc69Q3TCJ8 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc69Q3TCJ8 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc69Q3TCJ8 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc69Q3TCJ8 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc69Q3TCJ8 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc69Q3TCJ8 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc69Q3TCJ8 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc69Q3TCJ8 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc69Q3TCJ8 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc69Q3TCJ8 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc69Q3TCJ8 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc69Q3TCJ8 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc69Q3TCJ8 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc69Q3TCJ8 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc69Q3TCJ8 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc69Q3TCJ8 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc69Q3TCJ8 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc69Q3TCJ8 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc69Q3TCJ8 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc69Q3TCJ8 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc69Q3TCJ8 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc69Q3TCJ8 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc69Q3TCJ8 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc69Q3TCJ8 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc69Q3TCJ8 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc69Q3TCJ8 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc69Q3TCJ8 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc69Q3TCJ8 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc69Q3TCJ8 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc69Q3TCJ8 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc69Q3TCJ8 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc69Q3TCJ8 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc69Q3TCJ8 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc69Q3TCJ8 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc69Q3TCJ8 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc69Q3TCJ8 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc69Q3TCJ8 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc69Q3TCJ8 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc69Q3TCJ8 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc69Q3TCJ8 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc69Q3TCJ8 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc69Q3TCJ8 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc69Q3TCJ8 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc69Q3TCJ8 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc69Q3TCJ8 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc69Q3TCJ8 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc69Q3TCJ8 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc69Q3TCJ8 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc69Q3TCJ8 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc69Q3TCJ8 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc69Q3TCJ8 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc69Q3TCJ8 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc69Q3TCJ8 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc69Q3TCJ8 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc69Q3TCJ8 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc69Q3TCJ8 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc69Q3TCJ8 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc69Q3TCJ8 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc69Q3TCJ8 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc69Q3TCJ8 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc69Q3TCJ8 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc69Q3TCJ8 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc69Q3TCJ8 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc69Q3TCJ8 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc69Q3TCJ8 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc69Q3TCJ8 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc69Q3TCJ8 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc69Q3TCJ8 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc69Q3TCJ8 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc69Q3TCJ8 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc69Q3TCJ8 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc69Q3TCJ8 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc69Q3TCJ8 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc69Q3TCJ8 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc69Q3TCJ8 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc69Q3TCJ8 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc69Q3TCJ8 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc69Q3TCJ8 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc69Q3TCJ8 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc69Q3TCJ8 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc69Q3TCJ8 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc69Q3TCJ8 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc69Q3TCJ8 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc69Q3TCJ8 Gm13857-203ENSMUST00000150561 2337 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc69Q3TCJ8 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc69Q3TCJ8 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc69Q3TCJ8 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc69Q3TCJ8 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc69Q3TCJ8 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc69Q3TCJ8 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc69Q3TCJ8 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc69Q3TCJ8 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms