Protein–RNA interactions for Protein: Q3TBN1

Tmem248, Transmembrane protein 248, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem248Q3TBN1 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmem248Q3TBN1 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmem248Q3TBN1 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmem248Q3TBN1 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmem248Q3TBN1 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmem248Q3TBN1 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmem248Q3TBN1 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmem248Q3TBN1 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmem248Q3TBN1 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmem248Q3TBN1 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmem248Q3TBN1 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmem248Q3TBN1 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmem248Q3TBN1 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmem248Q3TBN1 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmem248Q3TBN1 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmem248Q3TBN1 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmem248Q3TBN1 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmem248Q3TBN1 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmem248Q3TBN1 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmem248Q3TBN1 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmem248Q3TBN1 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmem248Q3TBN1 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmem248Q3TBN1 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmem248Q3TBN1 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmem248Q3TBN1 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmem248Q3TBN1 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmem248Q3TBN1 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmem248Q3TBN1 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmem248Q3TBN1 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmem248Q3TBN1 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmem248Q3TBN1 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmem248Q3TBN1 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmem248Q3TBN1 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmem248Q3TBN1 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmem248Q3TBN1 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmem248Q3TBN1 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmem248Q3TBN1 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmem248Q3TBN1 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmem248Q3TBN1 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmem248Q3TBN1 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmem248Q3TBN1 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmem248Q3TBN1 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmem248Q3TBN1 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmem248Q3TBN1 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmem248Q3TBN1 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmem248Q3TBN1 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmem248Q3TBN1 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmem248Q3TBN1 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmem248Q3TBN1 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmem248Q3TBN1 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmem248Q3TBN1 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmem248Q3TBN1 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmem248Q3TBN1 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmem248Q3TBN1 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmem248Q3TBN1 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmem248Q3TBN1 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmem248Q3TBN1 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmem248Q3TBN1 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmem248Q3TBN1 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmem248Q3TBN1 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmem248Q3TBN1 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmem248Q3TBN1 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmem248Q3TBN1 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmem248Q3TBN1 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmem248Q3TBN1 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmem248Q3TBN1 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmem248Q3TBN1 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmem248Q3TBN1 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmem248Q3TBN1 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmem248Q3TBN1 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmem248Q3TBN1 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmem248Q3TBN1 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmem248Q3TBN1 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmem248Q3TBN1 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmem248Q3TBN1 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmem248Q3TBN1 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmem248Q3TBN1 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmem248Q3TBN1 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmem248Q3TBN1 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmem248Q3TBN1 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmem248Q3TBN1 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmem248Q3TBN1 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmem248Q3TBN1 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmem248Q3TBN1 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmem248Q3TBN1 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmem248Q3TBN1 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmem248Q3TBN1 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmem248Q3TBN1 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmem248Q3TBN1 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmem248Q3TBN1 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmem248Q3TBN1 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem248Q3TBN1 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem248Q3TBN1 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem248Q3TBN1 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem248Q3TBN1 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem248Q3TBN1 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem248Q3TBN1 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem248Q3TBN1 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem248Q3TBN1 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem248Q3TBN1 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms