Protein–RNA interactions for Protein: Q08460

Kcnma1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnma1Q08460 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Kcnma1Q08460 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Kcnma1Q08460 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Kcnma1Q08460 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Kcnma1Q08460 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Kcnma1Q08460 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Kcnma1Q08460 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Kcnma1Q08460 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Kcnma1Q08460 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Kcnma1Q08460 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Kcnma1Q08460 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Kcnma1Q08460 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Kcnma1Q08460 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Kcnma1Q08460 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Kcnma1Q08460 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Kcnma1Q08460 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Kcnma1Q08460 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Kcnma1Q08460 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Kcnma1Q08460 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Kcnma1Q08460 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Kcnma1Q08460 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Kcnma1Q08460 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Kcnma1Q08460 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Kcnma1Q08460 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Kcnma1Q08460 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Kcnma1Q08460 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Kcnma1Q08460 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Kcnma1Q08460 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Kcnma1Q08460 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Kcnma1Q08460 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Kcnma1Q08460 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Kcnma1Q08460 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Kcnma1Q08460 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Kcnma1Q08460 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Kcnma1Q08460 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Kcnma1Q08460 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Kcnma1Q08460 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Kcnma1Q08460 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Kcnma1Q08460 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Kcnma1Q08460 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Kcnma1Q08460 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Kcnma1Q08460 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Kcnma1Q08460 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Kcnma1Q08460 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Kcnma1Q08460 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Kcnma1Q08460 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Kcnma1Q08460 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Kcnma1Q08460 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Kcnma1Q08460 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Kcnma1Q08460 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Kcnma1Q08460 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Kcnma1Q08460 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Kcnma1Q08460 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Kcnma1Q08460 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Kcnma1Q08460 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Kcnma1Q08460 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Kcnma1Q08460 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Kcnma1Q08460 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Kcnma1Q08460 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Kcnma1Q08460 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Kcnma1Q08460 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Kcnma1Q08460 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Kcnma1Q08460 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Kcnma1Q08460 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Kcnma1Q08460 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Kcnma1Q08460 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Kcnma1Q08460 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Kcnma1Q08460 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Kcnma1Q08460 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Kcnma1Q08460 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Kcnma1Q08460 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Kcnma1Q08460 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Kcnma1Q08460 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Kcnma1Q08460 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Kcnma1Q08460 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Kcnma1Q08460 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Kcnma1Q08460 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Kcnma1Q08460 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Kcnma1Q08460 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Kcnma1Q08460 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Kcnma1Q08460 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Kcnma1Q08460 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Kcnma1Q08460 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Kcnma1Q08460 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Kcnma1Q08460 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Kcnma1Q08460 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Kcnma1Q08460 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Kcnma1Q08460 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Kcnma1Q08460 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Kcnma1Q08460 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Kcnma1Q08460 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Kcnma1Q08460 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Kcnma1Q08460 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Kcnma1Q08460 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Kcnma1Q08460 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Kcnma1Q08460 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Kcnma1Q08460 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Kcnma1Q08460 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Kcnma1Q08460 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Kcnma1Q08460 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.1 ms