Protein–RNA interactions for Protein: Q08369

Gata4, Transcription factor GATA-4, mousemouse

Predictions only

Length 441 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gata4Q08369 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gata4Q08369 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gata4Q08369 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gata4Q08369 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gata4Q08369 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gata4Q08369 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gata4Q08369 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gata4Q08369 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gata4Q08369 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gata4Q08369 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gata4Q08369 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gata4Q08369 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gata4Q08369 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gata4Q08369 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gata4Q08369 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gata4Q08369 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gata4Q08369 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gata4Q08369 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gata4Q08369 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gata4Q08369 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gata4Q08369 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gata4Q08369 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gata4Q08369 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gata4Q08369 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gata4Q08369 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gata4Q08369 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gata4Q08369 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gata4Q08369 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gata4Q08369 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gata4Q08369 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gata4Q08369 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gata4Q08369 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gata4Q08369 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gata4Q08369 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gata4Q08369 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gata4Q08369 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gata4Q08369 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gata4Q08369 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gata4Q08369 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gata4Q08369 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gata4Q08369 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gata4Q08369 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gata4Q08369 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gata4Q08369 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gata4Q08369 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gata4Q08369 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gata4Q08369 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gata4Q08369 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gata4Q08369 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gata4Q08369 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gata4Q08369 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gata4Q08369 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gata4Q08369 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gata4Q08369 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gata4Q08369 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gata4Q08369 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gata4Q08369 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gata4Q08369 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gata4Q08369 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gata4Q08369 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gata4Q08369 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gata4Q08369 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gata4Q08369 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gata4Q08369 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gata4Q08369 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gata4Q08369 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gata4Q08369 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gata4Q08369 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gata4Q08369 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gata4Q08369 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gata4Q08369 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gata4Q08369 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gata4Q08369 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gata4Q08369 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gata4Q08369 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gata4Q08369 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gata4Q08369 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gata4Q08369 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gata4Q08369 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gata4Q08369 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gata4Q08369 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gata4Q08369 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Gata4Q08369 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gata4Q08369 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gata4Q08369 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Gata4Q08369 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gata4Q08369 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gata4Q08369 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gata4Q08369 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gata4Q08369 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gata4Q08369 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gata4Q08369 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gata4Q08369 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gata4Q08369 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gata4Q08369 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gata4Q08369 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gata4Q08369 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gata4Q08369 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gata4Q08369 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gata4Q08369 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms