Protein–RNA interactions for Protein: Q07475

Nrep, Neuronal regeneration-related protein, mousemouse

Predictions only

Length 68 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NrepQ07475 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
NrepQ07475 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
NrepQ07475 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
NrepQ07475 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
NrepQ07475 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
NrepQ07475 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
NrepQ07475 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
NrepQ07475 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
NrepQ07475 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
NrepQ07475 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
NrepQ07475 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
NrepQ07475 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
NrepQ07475 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
NrepQ07475 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
NrepQ07475 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
NrepQ07475 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
NrepQ07475 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
NrepQ07475 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
NrepQ07475 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
NrepQ07475 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
NrepQ07475 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
NrepQ07475 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
NrepQ07475 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
NrepQ07475 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
NrepQ07475 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
NrepQ07475 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
NrepQ07475 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
NrepQ07475 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
NrepQ07475 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
NrepQ07475 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
NrepQ07475 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
NrepQ07475 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
NrepQ07475 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
NrepQ07475 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
NrepQ07475 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
NrepQ07475 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
NrepQ07475 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
NrepQ07475 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
NrepQ07475 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
NrepQ07475 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
NrepQ07475 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
NrepQ07475 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
NrepQ07475 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
NrepQ07475 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
NrepQ07475 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
NrepQ07475 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
NrepQ07475 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
NrepQ07475 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
NrepQ07475 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
NrepQ07475 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
NrepQ07475 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
NrepQ07475 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
NrepQ07475 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
NrepQ07475 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
NrepQ07475 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
NrepQ07475 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
NrepQ07475 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
NrepQ07475 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
NrepQ07475 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
NrepQ07475 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
NrepQ07475 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
NrepQ07475 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
NrepQ07475 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
NrepQ07475 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
NrepQ07475 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
NrepQ07475 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
NrepQ07475 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
NrepQ07475 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
NrepQ07475 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
NrepQ07475 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
NrepQ07475 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
NrepQ07475 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
NrepQ07475 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
NrepQ07475 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
NrepQ07475 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
NrepQ07475 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
NrepQ07475 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
NrepQ07475 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
NrepQ07475 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
NrepQ07475 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
NrepQ07475 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
NrepQ07475 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
NrepQ07475 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
NrepQ07475 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
NrepQ07475 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
NrepQ07475 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
NrepQ07475 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
NrepQ07475 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
NrepQ07475 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
NrepQ07475 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
NrepQ07475 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
NrepQ07475 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
NrepQ07475 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
NrepQ07475 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
NrepQ07475 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
NrepQ07475 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
NrepQ07475 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
NrepQ07475 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
NrepQ07475 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
NrepQ07475 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms