Protein–RNA interactions for Protein: Q03517

Scg2, Secretogranin-2, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scg2Q03517 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Scg2Q03517 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Scg2Q03517 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Scg2Q03517 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Scg2Q03517 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Scg2Q03517 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Scg2Q03517 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Scg2Q03517 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Scg2Q03517 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Scg2Q03517 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Scg2Q03517 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Scg2Q03517 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Scg2Q03517 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Scg2Q03517 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Scg2Q03517 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Scg2Q03517 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Scg2Q03517 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Scg2Q03517 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Scg2Q03517 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Scg2Q03517 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Scg2Q03517 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Scg2Q03517 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Scg2Q03517 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Scg2Q03517 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Scg2Q03517 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Scg2Q03517 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.58
Scg2Q03517 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Scg2Q03517 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Scg2Q03517 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Scg2Q03517 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Scg2Q03517 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Scg2Q03517 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Scg2Q03517 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Scg2Q03517 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Scg2Q03517 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Scg2Q03517 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Scg2Q03517 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Scg2Q03517 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Scg2Q03517 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Scg2Q03517 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Scg2Q03517 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Scg2Q03517 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Scg2Q03517 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Scg2Q03517 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Scg2Q03517 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Scg2Q03517 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Scg2Q03517 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Scg2Q03517 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Scg2Q03517 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Scg2Q03517 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Scg2Q03517 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Scg2Q03517 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Scg2Q03517 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Scg2Q03517 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Scg2Q03517 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Scg2Q03517 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Scg2Q03517 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Scg2Q03517 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Scg2Q03517 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Scg2Q03517 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Scg2Q03517 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Scg2Q03517 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Scg2Q03517 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Scg2Q03517 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Scg2Q03517 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Scg2Q03517 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Scg2Q03517 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Scg2Q03517 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Scg2Q03517 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Scg2Q03517 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Scg2Q03517 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Scg2Q03517 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Scg2Q03517 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Scg2Q03517 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Scg2Q03517 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Scg2Q03517 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Scg2Q03517 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Scg2Q03517 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Scg2Q03517 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Scg2Q03517 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Scg2Q03517 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Scg2Q03517 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Scg2Q03517 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Scg2Q03517 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Scg2Q03517 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Scg2Q03517 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Scg2Q03517 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Scg2Q03517 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Scg2Q03517 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Scg2Q03517 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Scg2Q03517 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Scg2Q03517 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Scg2Q03517 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Scg2Q03517 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Scg2Q03517 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Scg2Q03517 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Scg2Q03517 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Scg2Q03517 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Scg2Q03517 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Scg2Q03517 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms