Protein–RNA interactions for Protein: Q03146

Ddr1, Epithelial discoidin domain-containing receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddr1Q03146 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ddr1Q03146 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ddr1Q03146 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ddr1Q03146 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ddr1Q03146 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ddr1Q03146 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ddr1Q03146 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ddr1Q03146 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ddr1Q03146 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ddr1Q03146 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ddr1Q03146 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ddr1Q03146 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ddr1Q03146 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ddr1Q03146 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ddr1Q03146 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ddr1Q03146 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ddr1Q03146 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ddr1Q03146 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ddr1Q03146 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ddr1Q03146 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ddr1Q03146 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ddr1Q03146 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ddr1Q03146 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ddr1Q03146 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ddr1Q03146 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Ddr1Q03146 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Ddr1Q03146 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ddr1Q03146 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ddr1Q03146 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ddr1Q03146 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ddr1Q03146 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ddr1Q03146 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ddr1Q03146 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ddr1Q03146 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ddr1Q03146 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ddr1Q03146 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ddr1Q03146 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ddr1Q03146 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ddr1Q03146 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ddr1Q03146 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ddr1Q03146 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ddr1Q03146 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ddr1Q03146 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ddr1Q03146 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ddr1Q03146 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ddr1Q03146 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ddr1Q03146 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ddr1Q03146 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ddr1Q03146 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ddr1Q03146 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ddr1Q03146 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ddr1Q03146 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ddr1Q03146 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ddr1Q03146 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ddr1Q03146 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ddr1Q03146 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ddr1Q03146 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ddr1Q03146 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ddr1Q03146 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ddr1Q03146 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ddr1Q03146 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ddr1Q03146 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ddr1Q03146 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Ddr1Q03146 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ddr1Q03146 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ddr1Q03146 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ddr1Q03146 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ddr1Q03146 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ddr1Q03146 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ddr1Q03146 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ddr1Q03146 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ddr1Q03146 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ddr1Q03146 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ddr1Q03146 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ddr1Q03146 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ddr1Q03146 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ddr1Q03146 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ddr1Q03146 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ddr1Q03146 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ddr1Q03146 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ddr1Q03146 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ddr1Q03146 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ddr1Q03146 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Ddr1Q03146 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ddr1Q03146 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ddr1Q03146 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ddr1Q03146 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ddr1Q03146 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ddr1Q03146 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ddr1Q03146 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ddr1Q03146 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ddr1Q03146 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ddr1Q03146 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ddr1Q03146 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ddr1Q03146 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ddr1Q03146 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ddr1Q03146 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Ddr1Q03146 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ddr1Q03146 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ddr1Q03146 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59 ms