Protein–RNA interactions for Protein: Q00896

Serpina1c, Alpha-1-antitrypsin 1-3, mousemouse

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Serpina1cQ00896 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Serpina1cQ00896 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Serpina1cQ00896 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Serpina1cQ00896 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Serpina1cQ00896 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Serpina1cQ00896 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Serpina1cQ00896 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Serpina1cQ00896 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Serpina1cQ00896 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Serpina1cQ00896 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Serpina1cQ00896 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Serpina1cQ00896 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Serpina1cQ00896 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Serpina1cQ00896 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Serpina1cQ00896 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Serpina1cQ00896 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Serpina1cQ00896 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Serpina1cQ00896 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Serpina1cQ00896 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Serpina1cQ00896 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Serpina1cQ00896 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Serpina1cQ00896 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Serpina1cQ00896 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Serpina1cQ00896 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Serpina1cQ00896 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Serpina1cQ00896 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Serpina1cQ00896 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Serpina1cQ00896 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Serpina1cQ00896 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Serpina1cQ00896 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Serpina1cQ00896 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Serpina1cQ00896 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Serpina1cQ00896 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Serpina1cQ00896 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Serpina1cQ00896 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Serpina1cQ00896 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Serpina1cQ00896 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Serpina1cQ00896 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Serpina1cQ00896 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Serpina1cQ00896 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Serpina1cQ00896 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Serpina1cQ00896 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Serpina1cQ00896 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Serpina1cQ00896 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Serpina1cQ00896 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Serpina1cQ00896 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Serpina1cQ00896 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Serpina1cQ00896 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Serpina1cQ00896 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Serpina1cQ00896 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Serpina1cQ00896 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Serpina1cQ00896 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Serpina1cQ00896 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Serpina1cQ00896 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Serpina1cQ00896 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Serpina1cQ00896 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Serpina1cQ00896 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Serpina1cQ00896 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Serpina1cQ00896 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Serpina1cQ00896 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Serpina1cQ00896 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Serpina1cQ00896 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Serpina1cQ00896 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Serpina1cQ00896 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Serpina1cQ00896 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Serpina1cQ00896 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Serpina1cQ00896 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Serpina1cQ00896 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Serpina1cQ00896 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Serpina1cQ00896 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Serpina1cQ00896 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Serpina1cQ00896 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Serpina1cQ00896 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Serpina1cQ00896 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Serpina1cQ00896 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Serpina1cQ00896 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Serpina1cQ00896 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Serpina1cQ00896 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Serpina1cQ00896 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Serpina1cQ00896 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Serpina1cQ00896 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Serpina1cQ00896 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Serpina1cQ00896 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Serpina1cQ00896 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Serpina1cQ00896 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Serpina1cQ00896 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Serpina1cQ00896 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Serpina1cQ00896 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Serpina1cQ00896 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Serpina1cQ00896 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Serpina1cQ00896 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Serpina1cQ00896 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Serpina1cQ00896 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Serpina1cQ00896 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Serpina1cQ00896 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Serpina1cQ00896 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Serpina1cQ00896 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Serpina1cQ00896 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Serpina1cQ00896 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Serpina1cQ00896 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms