Protein–RNA interactions for Protein: P81068

Irx1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx1P81068 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Irx1P81068 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Irx1P81068 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Irx1P81068 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Irx1P81068 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Irx1P81068 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Irx1P81068 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Irx1P81068 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Irx1P81068 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Irx1P81068 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Irx1P81068 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Irx1P81068 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Irx1P81068 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Irx1P81068 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Irx1P81068 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Irx1P81068 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Irx1P81068 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Irx1P81068 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Irx1P81068 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Irx1P81068 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Irx1P81068 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Irx1P81068 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Irx1P81068 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Irx1P81068 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Irx1P81068 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Irx1P81068 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Irx1P81068 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Irx1P81068 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Irx1P81068 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Irx1P81068 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Irx1P81068 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Irx1P81068 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Irx1P81068 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Irx1P81068 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Irx1P81068 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Irx1P81068 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Irx1P81068 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Irx1P81068 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Irx1P81068 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Irx1P81068 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Irx1P81068 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Irx1P81068 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Irx1P81068 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Irx1P81068 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Irx1P81068 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Irx1P81068 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Irx1P81068 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Irx1P81068 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Irx1P81068 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Irx1P81068 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Irx1P81068 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Irx1P81068 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Irx1P81068 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Irx1P81068 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Irx1P81068 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Irx1P81068 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Irx1P81068 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Irx1P81068 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Irx1P81068 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Irx1P81068 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Irx1P81068 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Irx1P81068 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Irx1P81068 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Irx1P81068 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Irx1P81068 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Irx1P81068 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Irx1P81068 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Irx1P81068 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
Irx1P81068 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Irx1P81068 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Irx1P81068 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Irx1P81068 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Irx1P81068 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Irx1P81068 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Irx1P81068 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Irx1P81068 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Irx1P81068 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Irx1P81068 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Irx1P81068 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Irx1P81068 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Irx1P81068 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Irx1P81068 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Irx1P81068 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Irx1P81068 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Irx1P81068 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Irx1P81068 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Irx1P81068 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Irx1P81068 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Irx1P81068 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Irx1P81068 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Irx1P81068 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Irx1P81068 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Irx1P81068 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Irx1P81068 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Irx1P81068 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Irx1P81068 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Irx1P81068 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Irx1P81068 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Irx1P81068 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Irx1P81068 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms