Protein–RNA interactions for Protein: P81066

Irx2, Iroquois-class homeodomain protein IRX-2, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx2P81066 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Irx2P81066 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Irx2P81066 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Irx2P81066 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Irx2P81066 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Irx2P81066 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Irx2P81066 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Irx2P81066 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Irx2P81066 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Irx2P81066 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Irx2P81066 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Irx2P81066 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Irx2P81066 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Irx2P81066 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Irx2P81066 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Irx2P81066 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Irx2P81066 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Irx2P81066 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Irx2P81066 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Irx2P81066 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Irx2P81066 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Irx2P81066 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Irx2P81066 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Irx2P81066 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Irx2P81066 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Irx2P81066 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Irx2P81066 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Irx2P81066 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Irx2P81066 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Irx2P81066 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Irx2P81066 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Irx2P81066 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Irx2P81066 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Irx2P81066 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Irx2P81066 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Irx2P81066 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Irx2P81066 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Irx2P81066 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Irx2P81066 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Irx2P81066 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Irx2P81066 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Irx2P81066 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Irx2P81066 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Irx2P81066 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Irx2P81066 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Irx2P81066 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Irx2P81066 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Irx2P81066 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Irx2P81066 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Irx2P81066 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Irx2P81066 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Irx2P81066 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Irx2P81066 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Irx2P81066 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Irx2P81066 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Irx2P81066 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Irx2P81066 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Irx2P81066 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Irx2P81066 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Irx2P81066 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Irx2P81066 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Irx2P81066 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Irx2P81066 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Irx2P81066 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Irx2P81066 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Irx2P81066 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Irx2P81066 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Irx2P81066 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Irx2P81066 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Irx2P81066 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Irx2P81066 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Irx2P81066 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Irx2P81066 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Irx2P81066 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Irx2P81066 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Irx2P81066 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Irx2P81066 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Irx2P81066 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Irx2P81066 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Irx2P81066 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Irx2P81066 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Irx2P81066 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Irx2P81066 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Irx2P81066 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Irx2P81066 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Irx2P81066 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Irx2P81066 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Irx2P81066 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Irx2P81066 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Irx2P81066 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Irx2P81066 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Irx2P81066 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Irx2P81066 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Irx2P81066 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Irx2P81066 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Irx2P81066 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Irx2P81066 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Irx2P81066 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Irx2P81066 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Irx2P81066 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms