Protein–RNA interactions for Protein: P70122

Sbds, Ribosome maturation protein SBDS, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbdsP70122 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SbdsP70122 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SbdsP70122 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SbdsP70122 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SbdsP70122 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SbdsP70122 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SbdsP70122 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SbdsP70122 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SbdsP70122 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SbdsP70122 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SbdsP70122 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SbdsP70122 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SbdsP70122 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SbdsP70122 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SbdsP70122 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SbdsP70122 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SbdsP70122 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SbdsP70122 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SbdsP70122 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SbdsP70122 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SbdsP70122 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SbdsP70122 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SbdsP70122 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SbdsP70122 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SbdsP70122 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SbdsP70122 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
SbdsP70122 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SbdsP70122 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SbdsP70122 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SbdsP70122 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SbdsP70122 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SbdsP70122 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SbdsP70122 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SbdsP70122 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SbdsP70122 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SbdsP70122 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SbdsP70122 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SbdsP70122 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SbdsP70122 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SbdsP70122 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SbdsP70122 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SbdsP70122 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SbdsP70122 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SbdsP70122 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SbdsP70122 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SbdsP70122 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SbdsP70122 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SbdsP70122 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SbdsP70122 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SbdsP70122 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SbdsP70122 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SbdsP70122 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SbdsP70122 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
SbdsP70122 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SbdsP70122 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SbdsP70122 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SbdsP70122 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SbdsP70122 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SbdsP70122 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SbdsP70122 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SbdsP70122 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SbdsP70122 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SbdsP70122 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SbdsP70122 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SbdsP70122 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SbdsP70122 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SbdsP70122 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SbdsP70122 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SbdsP70122 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SbdsP70122 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SbdsP70122 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SbdsP70122 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SbdsP70122 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SbdsP70122 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SbdsP70122 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SbdsP70122 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
SbdsP70122 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SbdsP70122 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SbdsP70122 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
SbdsP70122 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
SbdsP70122 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SbdsP70122 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SbdsP70122 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
SbdsP70122 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SbdsP70122 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SbdsP70122 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SbdsP70122 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SbdsP70122 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SbdsP70122 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SbdsP70122 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SbdsP70122 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SbdsP70122 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SbdsP70122 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SbdsP70122 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SbdsP70122 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SbdsP70122 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SbdsP70122 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SbdsP70122 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SbdsP70122 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SbdsP70122 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms