Protein–RNA interactions for Protein: P61166

Tmem258, Transmembrane protein 258, mousemouse

Predictions only

Length 79 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem258P61166 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Tmem258P61166 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Tmem258P61166 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Tmem258P61166 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Tmem258P61166 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Tmem258P61166 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Tmem258P61166 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tmem258P61166 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tmem258P61166 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tmem258P61166 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tmem258P61166 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tmem258P61166 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tmem258P61166 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tmem258P61166 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tmem258P61166 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tmem258P61166 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tmem258P61166 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tmem258P61166 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tmem258P61166 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tmem258P61166 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tmem258P61166 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tmem258P61166 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tmem258P61166 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tmem258P61166 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tmem258P61166 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tmem258P61166 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tmem258P61166 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tmem258P61166 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tmem258P61166 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tmem258P61166 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tmem258P61166 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tmem258P61166 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tmem258P61166 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tmem258P61166 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tmem258P61166 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tmem258P61166 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tmem258P61166 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tmem258P61166 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tmem258P61166 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tmem258P61166 Zmiz1-208ENSMUST00000162645 7482 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tmem258P61166 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tmem258P61166 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tmem258P61166 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Tmem258P61166 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Tmem258P61166 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
Tmem258P61166 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Tmem258P61166 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Tmem258P61166 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Tmem258P61166 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Tmem258P61166 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Tmem258P61166 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Tmem258P61166 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Tmem258P61166 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Tmem258P61166 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Tmem258P61166 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Tmem258P61166 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Tmem258P61166 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Tmem258P61166 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Tmem258P61166 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Tmem258P61166 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Tmem258P61166 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Tmem258P61166 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Tmem258P61166 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Tmem258P61166 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Tmem258P61166 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Tmem258P61166 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Tmem258P61166 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Tmem258P61166 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Tmem258P61166 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Tmem258P61166 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Tmem258P61166 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Tmem258P61166 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Tmem258P61166 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Tmem258P61166 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Tmem258P61166 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Tmem258P61166 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Tmem258P61166 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Tmem258P61166 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Tmem258P61166 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Tmem258P61166 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Tmem258P61166 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Tmem258P61166 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Tmem258P61166 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Tmem258P61166 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Tmem258P61166 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Tmem258P61166 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Tmem258P61166 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Tmem258P61166 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Tmem258P61166 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Tmem258P61166 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Tmem258P61166 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Tmem258P61166 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Tmem258P61166 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Tmem258P61166 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Tmem258P61166 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Tmem258P61166 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Tmem258P61166 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Tmem258P61166 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Tmem258P61166 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Tmem258P61166 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
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