Protein–RNA interactions for Protein: P61021

Rab5b, Ras-related protein Rab-5B, mousemouse

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Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab5bP61021 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rab5bP61021 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rab5bP61021 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rab5bP61021 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rab5bP61021 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rab5bP61021 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rab5bP61021 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rab5bP61021 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rab5bP61021 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rab5bP61021 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rab5bP61021 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rab5bP61021 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rab5bP61021 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Rab5bP61021 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rab5bP61021 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rab5bP61021 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rab5bP61021 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rab5bP61021 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rab5bP61021 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rab5bP61021 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rab5bP61021 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rab5bP61021 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rab5bP61021 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rab5bP61021 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rab5bP61021 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rab5bP61021 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rab5bP61021 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rab5bP61021 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rab5bP61021 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Rab5bP61021 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rab5bP61021 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Rab5bP61021 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rab5bP61021 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rab5bP61021 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rab5bP61021 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rab5bP61021 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rab5bP61021 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rab5bP61021 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rab5bP61021 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rab5bP61021 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rab5bP61021 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rab5bP61021 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rab5bP61021 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rab5bP61021 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rab5bP61021 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rab5bP61021 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rab5bP61021 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rab5bP61021 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Rab5bP61021 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rab5bP61021 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rab5bP61021 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rab5bP61021 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rab5bP61021 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rab5bP61021 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Rab5bP61021 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rab5bP61021 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rab5bP61021 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Rab5bP61021 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rab5bP61021 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rab5bP61021 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rab5bP61021 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rab5bP61021 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Rab5bP61021 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rab5bP61021 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rab5bP61021 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rab5bP61021 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rab5bP61021 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rab5bP61021 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rab5bP61021 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rab5bP61021 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rab5bP61021 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rab5bP61021 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rab5bP61021 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rab5bP61021 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rab5bP61021 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rab5bP61021 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rab5bP61021 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rab5bP61021 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rab5bP61021 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rab5bP61021 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rab5bP61021 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rab5bP61021 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rab5bP61021 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rab5bP61021 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rab5bP61021 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rab5bP61021 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rab5bP61021 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rab5bP61021 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rab5bP61021 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rab5bP61021 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rab5bP61021 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rab5bP61021 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rab5bP61021 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rab5bP61021 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rab5bP61021 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rab5bP61021 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rab5bP61021 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Rab5bP61021 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rab5bP61021 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rab5bP61021 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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