Protein–RNA interactions for Protein: P58242

Smpdl3b, Acid sphingomyelinase-like phosphodiesterase 3b, mousemouse

Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpdl3bP58242 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smpdl3bP58242 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smpdl3bP58242 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Smpdl3bP58242 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Smpdl3bP58242 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Smpdl3bP58242 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Smpdl3bP58242 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Smpdl3bP58242 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Smpdl3bP58242 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Smpdl3bP58242 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Smpdl3bP58242 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Smpdl3bP58242 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Smpdl3bP58242 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Smpdl3bP58242 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Smpdl3bP58242 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Smpdl3bP58242 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Smpdl3bP58242 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Smpdl3bP58242 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Smpdl3bP58242 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Smpdl3bP58242 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Smpdl3bP58242 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Smpdl3bP58242 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Smpdl3bP58242 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smpdl3bP58242 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smpdl3bP58242 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smpdl3bP58242 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smpdl3bP58242 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smpdl3bP58242 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smpdl3bP58242 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smpdl3bP58242 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smpdl3bP58242 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smpdl3bP58242 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smpdl3bP58242 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smpdl3bP58242 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smpdl3bP58242 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smpdl3bP58242 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smpdl3bP58242 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Smpdl3bP58242 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Smpdl3bP58242 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smpdl3bP58242 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smpdl3bP58242 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smpdl3bP58242 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smpdl3bP58242 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smpdl3bP58242 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smpdl3bP58242 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smpdl3bP58242 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smpdl3bP58242 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Smpdl3bP58242 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smpdl3bP58242 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smpdl3bP58242 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smpdl3bP58242 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smpdl3bP58242 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smpdl3bP58242 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smpdl3bP58242 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smpdl3bP58242 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smpdl3bP58242 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smpdl3bP58242 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smpdl3bP58242 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smpdl3bP58242 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smpdl3bP58242 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smpdl3bP58242 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smpdl3bP58242 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smpdl3bP58242 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smpdl3bP58242 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smpdl3bP58242 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smpdl3bP58242 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smpdl3bP58242 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smpdl3bP58242 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smpdl3bP58242 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smpdl3bP58242 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smpdl3bP58242 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smpdl3bP58242 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smpdl3bP58242 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smpdl3bP58242 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smpdl3bP58242 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smpdl3bP58242 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smpdl3bP58242 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smpdl3bP58242 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smpdl3bP58242 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Smpdl3bP58242 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smpdl3bP58242 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smpdl3bP58242 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smpdl3bP58242 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smpdl3bP58242 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smpdl3bP58242 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smpdl3bP58242 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smpdl3bP58242 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smpdl3bP58242 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smpdl3bP58242 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smpdl3bP58242 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smpdl3bP58242 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smpdl3bP58242 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smpdl3bP58242 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smpdl3bP58242 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smpdl3bP58242 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smpdl3bP58242 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smpdl3bP58242 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smpdl3bP58242 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smpdl3bP58242 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smpdl3bP58242 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms