Protein–RNA interactions for Protein: P56812

Pdcd5, Programmed cell death protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcd5P56812 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pdcd5P56812 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pdcd5P56812 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pdcd5P56812 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pdcd5P56812 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Pdcd5P56812 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pdcd5P56812 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pdcd5P56812 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pdcd5P56812 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pdcd5P56812 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pdcd5P56812 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pdcd5P56812 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pdcd5P56812 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pdcd5P56812 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pdcd5P56812 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pdcd5P56812 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pdcd5P56812 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pdcd5P56812 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pdcd5P56812 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pdcd5P56812 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pdcd5P56812 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pdcd5P56812 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pdcd5P56812 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pdcd5P56812 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pdcd5P56812 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pdcd5P56812 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pdcd5P56812 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pdcd5P56812 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pdcd5P56812 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pdcd5P56812 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pdcd5P56812 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Pdcd5P56812 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pdcd5P56812 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pdcd5P56812 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pdcd5P56812 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pdcd5P56812 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pdcd5P56812 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pdcd5P56812 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pdcd5P56812 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pdcd5P56812 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pdcd5P56812 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pdcd5P56812 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pdcd5P56812 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pdcd5P56812 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pdcd5P56812 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pdcd5P56812 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pdcd5P56812 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pdcd5P56812 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pdcd5P56812 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pdcd5P56812 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pdcd5P56812 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pdcd5P56812 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pdcd5P56812 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pdcd5P56812 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pdcd5P56812 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pdcd5P56812 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pdcd5P56812 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pdcd5P56812 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pdcd5P56812 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pdcd5P56812 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Pdcd5P56812 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Pdcd5P56812 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Pdcd5P56812 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pdcd5P56812 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pdcd5P56812 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pdcd5P56812 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pdcd5P56812 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pdcd5P56812 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pdcd5P56812 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pdcd5P56812 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pdcd5P56812 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pdcd5P56812 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pdcd5P56812 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pdcd5P56812 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pdcd5P56812 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pdcd5P56812 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pdcd5P56812 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pdcd5P56812 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pdcd5P56812 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pdcd5P56812 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pdcd5P56812 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pdcd5P56812 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pdcd5P56812 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pdcd5P56812 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pdcd5P56812 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pdcd5P56812 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pdcd5P56812 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Pdcd5P56812 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pdcd5P56812 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pdcd5P56812 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pdcd5P56812 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pdcd5P56812 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pdcd5P56812 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pdcd5P56812 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pdcd5P56812 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Pdcd5P56812 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pdcd5P56812 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pdcd5P56812 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pdcd5P56812 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pdcd5P56812 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms