Protein–RNA interactions for Protein: P52194

Clgn, Calmegin, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClgnP52194 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ClgnP52194 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ClgnP52194 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ClgnP52194 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ClgnP52194 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
ClgnP52194 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
ClgnP52194 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ClgnP52194 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ClgnP52194 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ClgnP52194 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ClgnP52194 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ClgnP52194 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
ClgnP52194 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ClgnP52194 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ClgnP52194 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ClgnP52194 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ClgnP52194 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ClgnP52194 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ClgnP52194 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ClgnP52194 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ClgnP52194 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ClgnP52194 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ClgnP52194 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ClgnP52194 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ClgnP52194 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ClgnP52194 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ClgnP52194 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ClgnP52194 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ClgnP52194 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
ClgnP52194 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
ClgnP52194 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ClgnP52194 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ClgnP52194 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ClgnP52194 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ClgnP52194 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ClgnP52194 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ClgnP52194 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ClgnP52194 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ClgnP52194 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ClgnP52194 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ClgnP52194 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ClgnP52194 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ClgnP52194 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ClgnP52194 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ClgnP52194 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ClgnP52194 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ClgnP52194 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
ClgnP52194 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ClgnP52194 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
ClgnP52194 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ClgnP52194 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ClgnP52194 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ClgnP52194 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
ClgnP52194 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ClgnP52194 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ClgnP52194 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ClgnP52194 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ClgnP52194 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ClgnP52194 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ClgnP52194 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ClgnP52194 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ClgnP52194 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ClgnP52194 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ClgnP52194 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ClgnP52194 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ClgnP52194 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ClgnP52194 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ClgnP52194 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ClgnP52194 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ClgnP52194 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ClgnP52194 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ClgnP52194 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ClgnP52194 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ClgnP52194 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ClgnP52194 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ClgnP52194 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ClgnP52194 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
ClgnP52194 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ClgnP52194 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ClgnP52194 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ClgnP52194 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ClgnP52194 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ClgnP52194 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ClgnP52194 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ClgnP52194 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ClgnP52194 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ClgnP52194 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ClgnP52194 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ClgnP52194 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ClgnP52194 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ClgnP52194 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ClgnP52194 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ClgnP52194 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ClgnP52194 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ClgnP52194 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ClgnP52194 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
ClgnP52194 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
ClgnP52194 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ClgnP52194 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ClgnP52194 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms