Protein–RNA interactions for Protein: P51680

Ccr4, C-C chemokine receptor type 4, mousemouse

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccr4P51680 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccr4P51680 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccr4P51680 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccr4P51680 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccr4P51680 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccr4P51680 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccr4P51680 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccr4P51680 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccr4P51680 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccr4P51680 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccr4P51680 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccr4P51680 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccr4P51680 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccr4P51680 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccr4P51680 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccr4P51680 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccr4P51680 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccr4P51680 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccr4P51680 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccr4P51680 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccr4P51680 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccr4P51680 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccr4P51680 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccr4P51680 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccr4P51680 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccr4P51680 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccr4P51680 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccr4P51680 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccr4P51680 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccr4P51680 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccr4P51680 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccr4P51680 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccr4P51680 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccr4P51680 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccr4P51680 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccr4P51680 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccr4P51680 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccr4P51680 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccr4P51680 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccr4P51680 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccr4P51680 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccr4P51680 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccr4P51680 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccr4P51680 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccr4P51680 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccr4P51680 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccr4P51680 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccr4P51680 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccr4P51680 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccr4P51680 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccr4P51680 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccr4P51680 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccr4P51680 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccr4P51680 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccr4P51680 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccr4P51680 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccr4P51680 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccr4P51680 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccr4P51680 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccr4P51680 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccr4P51680 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccr4P51680 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccr4P51680 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccr4P51680 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccr4P51680 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccr4P51680 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccr4P51680 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccr4P51680 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccr4P51680 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccr4P51680 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccr4P51680 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccr4P51680 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccr4P51680 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccr4P51680 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccr4P51680 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccr4P51680 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccr4P51680 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccr4P51680 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccr4P51680 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccr4P51680 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccr4P51680 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccr4P51680 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccr4P51680 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccr4P51680 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccr4P51680 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccr4P51680 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccr4P51680 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccr4P51680 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccr4P51680 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccr4P51680 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccr4P51680 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccr4P51680 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccr4P51680 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccr4P51680 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccr4P51680 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccr4P51680 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccr4P51680 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccr4P51680 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccr4P51680 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccr4P51680 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.3 ms