Protein–RNA interactions for Protein: P49135

Ercc3, General transcription and DNA repair factor IIH helicase subunit XPB, mousemouse

Predictions only

Length 783 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc3P49135 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ercc3P49135 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ercc3P49135 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ercc3P49135 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ercc3P49135 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ercc3P49135 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ercc3P49135 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ercc3P49135 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ercc3P49135 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ercc3P49135 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ercc3P49135 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ercc3P49135 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ercc3P49135 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ercc3P49135 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ercc3P49135 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ercc3P49135 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ercc3P49135 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ercc3P49135 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ercc3P49135 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ercc3P49135 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ercc3P49135 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ercc3P49135 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ercc3P49135 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Ercc3P49135 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ercc3P49135 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ercc3P49135 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ercc3P49135 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ercc3P49135 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ercc3P49135 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ercc3P49135 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ercc3P49135 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ercc3P49135 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ercc3P49135 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ercc3P49135 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ercc3P49135 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ercc3P49135 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ercc3P49135 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ercc3P49135 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ercc3P49135 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ercc3P49135 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ercc3P49135 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ercc3P49135 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ercc3P49135 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ercc3P49135 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ercc3P49135 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ercc3P49135 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ercc3P49135 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ercc3P49135 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ercc3P49135 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ercc3P49135 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ercc3P49135 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ercc3P49135 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ercc3P49135 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ercc3P49135 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ercc3P49135 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ercc3P49135 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Ercc3P49135 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ercc3P49135 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ercc3P49135 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ercc3P49135 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ercc3P49135 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ercc3P49135 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ercc3P49135 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ercc3P49135 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ercc3P49135 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ercc3P49135 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ercc3P49135 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ercc3P49135 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ercc3P49135 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ercc3P49135 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ercc3P49135 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ercc3P49135 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Ercc3P49135 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ercc3P49135 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ercc3P49135 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ercc3P49135 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ercc3P49135 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Ercc3P49135 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ercc3P49135 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ercc3P49135 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ercc3P49135 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ercc3P49135 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ercc3P49135 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ercc3P49135 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ercc3P49135 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ercc3P49135 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ercc3P49135 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ercc3P49135 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ercc3P49135 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ercc3P49135 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Ercc3P49135 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ercc3P49135 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ercc3P49135 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ercc3P49135 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ercc3P49135 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ercc3P49135 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ercc3P49135 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ercc3P49135 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ercc3P49135 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ercc3P49135 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms