Protein–RNA interactions for Protein: P41539

Tac1, Protachykinin-1, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tac1P41539 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tac1P41539 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tac1P41539 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Tac1P41539 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tac1P41539 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tac1P41539 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tac1P41539 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tac1P41539 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tac1P41539 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tac1P41539 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Tac1P41539 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tac1P41539 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tac1P41539 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tac1P41539 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tac1P41539 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tac1P41539 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Tac1P41539 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tac1P41539 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tac1P41539 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tac1P41539 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tac1P41539 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tac1P41539 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tac1P41539 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tac1P41539 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tac1P41539 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tac1P41539 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tac1P41539 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tac1P41539 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tac1P41539 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tac1P41539 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tac1P41539 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tac1P41539 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tac1P41539 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tac1P41539 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tac1P41539 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tac1P41539 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tac1P41539 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tac1P41539 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tac1P41539 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tac1P41539 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tac1P41539 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tac1P41539 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tac1P41539 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tac1P41539 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tac1P41539 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tac1P41539 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tac1P41539 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tac1P41539 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Tac1P41539 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tac1P41539 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tac1P41539 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tac1P41539 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tac1P41539 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tac1P41539 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tac1P41539 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tac1P41539 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tac1P41539 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tac1P41539 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tac1P41539 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tac1P41539 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tac1P41539 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Tac1P41539 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tac1P41539 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tac1P41539 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tac1P41539 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tac1P41539 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tac1P41539 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tac1P41539 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tac1P41539 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tac1P41539 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tac1P41539 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tac1P41539 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tac1P41539 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tac1P41539 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tac1P41539 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tac1P41539 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tac1P41539 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tac1P41539 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tac1P41539 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tac1P41539 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tac1P41539 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tac1P41539 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tac1P41539 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tac1P41539 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tac1P41539 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tac1P41539 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tac1P41539 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tac1P41539 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tac1P41539 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tac1P41539 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tac1P41539 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tac1P41539 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tac1P41539 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tac1P41539 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tac1P41539 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tac1P41539 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tac1P41539 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tac1P41539 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tac1P41539 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tac1P41539 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms