Protein–RNA interactions for Protein: P40338

Vhl, von Hippel-Lindau disease tumor suppressor, mousemouse

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Length 181 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VhlP40338 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
VhlP40338 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
VhlP40338 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
VhlP40338 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
VhlP40338 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
VhlP40338 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
VhlP40338 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
VhlP40338 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
VhlP40338 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
VhlP40338 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
VhlP40338 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
VhlP40338 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
VhlP40338 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
VhlP40338 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
VhlP40338 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
VhlP40338 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
VhlP40338 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
VhlP40338 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
VhlP40338 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
VhlP40338 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
VhlP40338 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
VhlP40338 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
VhlP40338 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
VhlP40338 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
VhlP40338 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
VhlP40338 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
VhlP40338 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
VhlP40338 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
VhlP40338 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
VhlP40338 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
VhlP40338 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
VhlP40338 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
VhlP40338 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
VhlP40338 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
VhlP40338 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
VhlP40338 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
VhlP40338 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
VhlP40338 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
VhlP40338 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
VhlP40338 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
VhlP40338 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
VhlP40338 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
VhlP40338 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
VhlP40338 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
VhlP40338 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
VhlP40338 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
VhlP40338 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
VhlP40338 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
VhlP40338 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
VhlP40338 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
VhlP40338 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
VhlP40338 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
VhlP40338 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
VhlP40338 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
VhlP40338 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
VhlP40338 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
VhlP40338 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
VhlP40338 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
VhlP40338 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
VhlP40338 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
VhlP40338 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
VhlP40338 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
VhlP40338 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
VhlP40338 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
VhlP40338 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
VhlP40338 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
VhlP40338 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
VhlP40338 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
VhlP40338 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
VhlP40338 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
VhlP40338 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
VhlP40338 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
VhlP40338 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
VhlP40338 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
VhlP40338 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
VhlP40338 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
VhlP40338 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
VhlP40338 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
VhlP40338 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
VhlP40338 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
VhlP40338 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
VhlP40338 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
VhlP40338 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
VhlP40338 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
VhlP40338 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
VhlP40338 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
VhlP40338 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
VhlP40338 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
VhlP40338 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
VhlP40338 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
VhlP40338 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.27
VhlP40338 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
VhlP40338 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
VhlP40338 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
VhlP40338 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
VhlP40338 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
VhlP40338 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
VhlP40338 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
VhlP40338 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
VhlP40338 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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