Protein–RNA interactions for Protein: P31532

Saa4, Serum amyloid A-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Saa4P31532 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Saa4P31532 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Saa4P31532 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Saa4P31532 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Saa4P31532 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Saa4P31532 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Saa4P31532 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Saa4P31532 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Saa4P31532 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Saa4P31532 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Saa4P31532 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Saa4P31532 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Saa4P31532 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Saa4P31532 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Saa4P31532 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Saa4P31532 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Saa4P31532 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Saa4P31532 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Saa4P31532 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Saa4P31532 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Saa4P31532 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Saa4P31532 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Saa4P31532 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Saa4P31532 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Saa4P31532 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Saa4P31532 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Saa4P31532 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Saa4P31532 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Saa4P31532 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Saa4P31532 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Saa4P31532 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Saa4P31532 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Saa4P31532 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Saa4P31532 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Saa4P31532 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Saa4P31532 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Saa4P31532 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Saa4P31532 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Saa4P31532 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Saa4P31532 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Saa4P31532 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Saa4P31532 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Saa4P31532 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Saa4P31532 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Saa4P31532 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Saa4P31532 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Saa4P31532 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Saa4P31532 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Saa4P31532 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Saa4P31532 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Saa4P31532 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Saa4P31532 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Saa4P31532 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Saa4P31532 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Saa4P31532 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Saa4P31532 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Saa4P31532 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Saa4P31532 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Saa4P31532 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Saa4P31532 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Saa4P31532 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Saa4P31532 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Saa4P31532 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Saa4P31532 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Saa4P31532 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Saa4P31532 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Saa4P31532 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Saa4P31532 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Saa4P31532 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Saa4P31532 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Saa4P31532 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Saa4P31532 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Saa4P31532 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Saa4P31532 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Saa4P31532 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Saa4P31532 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Saa4P31532 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Saa4P31532 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Saa4P31532 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Saa4P31532 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Saa4P31532 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Saa4P31532 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Saa4P31532 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Saa4P31532 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Saa4P31532 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Saa4P31532 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Saa4P31532 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Saa4P31532 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Saa4P31532 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Saa4P31532 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Saa4P31532 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Saa4P31532 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Saa4P31532 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Saa4P31532 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Saa4P31532 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Saa4P31532 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Saa4P31532 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Saa4P31532 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Saa4P31532 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Saa4P31532 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms