Protein–RNA interactions for Protein: P31310

Hoxa10, Homeobox protein Hox-A10, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa10P31310 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxa10P31310 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxa10P31310 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxa10P31310 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxa10P31310 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxa10P31310 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxa10P31310 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxa10P31310 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxa10P31310 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxa10P31310 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxa10P31310 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxa10P31310 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxa10P31310 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxa10P31310 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxa10P31310 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxa10P31310 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxa10P31310 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxa10P31310 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxa10P31310 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxa10P31310 Ccl25-201ENSMUST00000024004 1058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxa10P31310 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxa10P31310 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxa10P31310 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxa10P31310 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxa10P31310 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxa10P31310 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxa10P31310 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxa10P31310 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxa10P31310 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxa10P31310 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxa10P31310 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxa10P31310 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxa10P31310 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxa10P31310 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxa10P31310 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxa10P31310 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxa10P31310 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxa10P31310 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxa10P31310 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxa10P31310 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxa10P31310 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxa10P31310 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxa10P31310 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxa10P31310 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxa10P31310 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxa10P31310 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxa10P31310 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxa10P31310 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxa10P31310 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxa10P31310 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxa10P31310 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxa10P31310 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxa10P31310 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxa10P31310 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxa10P31310 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxa10P31310 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxa10P31310 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxa10P31310 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxa10P31310 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxa10P31310 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxa10P31310 Dnmt3aos-201ENSMUST00000144896 1385 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxa10P31310 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxa10P31310 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxa10P31310 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxa10P31310 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxa10P31310 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxa10P31310 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxa10P31310 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxa10P31310 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxa10P31310 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxa10P31310 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxa10P31310 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxa10P31310 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxa10P31310 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxa10P31310 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxa10P31310 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hoxa10P31310 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hoxa10P31310 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hoxa10P31310 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hoxa10P31310 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hoxa10P31310 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hoxa10P31310 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hoxa10P31310 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hoxa10P31310 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hoxa10P31310 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxa10P31310 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxa10P31310 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxa10P31310 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxa10P31310 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxa10P31310 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxa10P31310 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxa10P31310 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxa10P31310 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxa10P31310 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxa10P31310 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxa10P31310 Lmo3-206ENSMUST00000163024 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxa10P31310 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxa10P31310 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxa10P31310 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxa10P31310 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms