Protein–RNA interactions for Protein: P26231

Ctnna1, Catenin alpha-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna1P26231 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ctnna1P26231 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ctnna1P26231 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ctnna1P26231 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ctnna1P26231 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ctnna1P26231 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ctnna1P26231 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ctnna1P26231 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ctnna1P26231 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Ctnna1P26231 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ctnna1P26231 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ctnna1P26231 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Ctnna1P26231 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Ctnna1P26231 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ctnna1P26231 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Ctnna1P26231 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ctnna1P26231 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ctnna1P26231 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ctnna1P26231 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ctnna1P26231 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ctnna1P26231 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ctnna1P26231 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Ctnna1P26231 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ctnna1P26231 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ctnna1P26231 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ctnna1P26231 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ctnna1P26231 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ctnna1P26231 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ctnna1P26231 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ctnna1P26231 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ctnna1P26231 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ctnna1P26231 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ctnna1P26231 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ctnna1P26231 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ctnna1P26231 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ctnna1P26231 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ctnna1P26231 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ctnna1P26231 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ctnna1P26231 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ctnna1P26231 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ctnna1P26231 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Ctnna1P26231 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ctnna1P26231 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ctnna1P26231 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Ctnna1P26231 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ctnna1P26231 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ctnna1P26231 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ctnna1P26231 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ctnna1P26231 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ctnna1P26231 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Ctnna1P26231 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ctnna1P26231 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ctnna1P26231 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ctnna1P26231 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ctnna1P26231 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ctnna1P26231 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ctnna1P26231 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ctnna1P26231 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ctnna1P26231 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ctnna1P26231 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ctnna1P26231 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ctnna1P26231 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ctnna1P26231 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ctnna1P26231 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ctnna1P26231 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ctnna1P26231 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ctnna1P26231 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ctnna1P26231 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ctnna1P26231 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Ctnna1P26231 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ctnna1P26231 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ctnna1P26231 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Ctnna1P26231 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ctnna1P26231 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ctnna1P26231 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ctnna1P26231 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ctnna1P26231 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ctnna1P26231 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ctnna1P26231 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ctnna1P26231 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ctnna1P26231 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ctnna1P26231 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Ctnna1P26231 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ctnna1P26231 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ctnna1P26231 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ctnna1P26231 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ctnna1P26231 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ctnna1P26231 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ctnna1P26231 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Ctnna1P26231 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ctnna1P26231 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ctnna1P26231 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ctnna1P26231 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ctnna1P26231 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ctnna1P26231 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ctnna1P26231 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ctnna1P26231 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ctnna1P26231 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ctnna1P26231 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Ctnna1P26231 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms