Protein–RNA interactions for Protein: P21841

Sftpc, Pulmonary surfactant-associated protein C, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpcP21841 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SftpcP21841 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SftpcP21841 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SftpcP21841 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SftpcP21841 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SftpcP21841 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SftpcP21841 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SftpcP21841 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SftpcP21841 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SftpcP21841 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SftpcP21841 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SftpcP21841 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SftpcP21841 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SftpcP21841 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
SftpcP21841 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.07
SftpcP21841 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
SftpcP21841 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
SftpcP21841 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SftpcP21841 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SftpcP21841 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SftpcP21841 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SftpcP21841 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SftpcP21841 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SftpcP21841 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SftpcP21841 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
SftpcP21841 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
SftpcP21841 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SftpcP21841 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SftpcP21841 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SftpcP21841 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SftpcP21841 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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SftpcP21841 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SftpcP21841 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SftpcP21841 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SftpcP21841 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SftpcP21841 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SftpcP21841 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SftpcP21841 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SftpcP21841 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SftpcP21841 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SftpcP21841 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SftpcP21841 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SftpcP21841 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SftpcP21841 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
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SftpcP21841 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SftpcP21841 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SftpcP21841 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SftpcP21841 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SftpcP21841 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SftpcP21841 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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SftpcP21841 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SftpcP21841 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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SftpcP21841 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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SftpcP21841 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SftpcP21841 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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SftpcP21841 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SftpcP21841 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SftpcP21841 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SftpcP21841 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SftpcP21841 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SftpcP21841 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SftpcP21841 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SftpcP21841 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SftpcP21841 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SftpcP21841 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SftpcP21841 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SftpcP21841 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SftpcP21841 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SftpcP21841 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SftpcP21841 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
SftpcP21841 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
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SftpcP21841 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SftpcP21841 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SftpcP21841 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SftpcP21841 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SftpcP21841 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SftpcP21841 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SftpcP21841 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SftpcP21841 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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