Protein–RNA interactions for Protein: P20293

T, Brachyury protein, mousemouse

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TP20293 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TP20293 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TP20293 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TP20293 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TP20293 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TP20293 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TP20293 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TP20293 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TP20293 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TP20293 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TP20293 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TP20293 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TP20293 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TP20293 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TP20293 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TP20293 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TP20293 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TP20293 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TP20293 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TP20293 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TP20293 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TP20293 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TP20293 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TP20293 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TP20293 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TP20293 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TP20293 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TP20293 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TP20293 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TP20293 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TP20293 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TP20293 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TP20293 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TP20293 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TP20293 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TP20293 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TP20293 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TP20293 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TP20293 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TP20293 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TP20293 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TP20293 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TP20293 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TP20293 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TP20293 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TP20293 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TP20293 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TP20293 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TP20293 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TP20293 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TP20293 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TP20293 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TP20293 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TP20293 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TP20293 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TP20293 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TP20293 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TP20293 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TP20293 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TP20293 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TP20293 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TP20293 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TP20293 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TP20293 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TP20293 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TP20293 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TP20293 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TP20293 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TP20293 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TP20293 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TP20293 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TP20293 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TP20293 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TP20293 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TP20293 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TP20293 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TP20293 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TP20293 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TP20293 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TP20293 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TP20293 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TP20293 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TP20293 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TP20293 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TP20293 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TP20293 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TP20293 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TP20293 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TP20293 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TP20293 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TP20293 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TP20293 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TP20293 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TP20293 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TP20293 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TP20293 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TP20293 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TP20293 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TP20293 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TP20293 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms